Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Otx1P80205 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Otx1P80205 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Otx1P80205 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Otx1P80205 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Otx1P80205 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Otx1P80205 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Otx1P80205 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Otx1P80205 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Otx1P80205 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Otx1P80205 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Otx1P80205 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Otx1P80205 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Otx1P80205 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otx1P80205 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otx1P80205 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otx1P80205 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otx1P80205 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otx1P80205 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otx1P80205 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Otx1P80205 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Otx1P80205 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Otx1P80205 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otx1P80205 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otx1P80205 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otx1P80205 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otx1P80205 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otx1P80205 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otx1P80205 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otx1P80205 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Otx1P80205 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Otx1P80205 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Otx1P80205 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otx1P80205 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otx1P80205 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otx1P80205 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otx1P80205 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otx1P80205 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otx1P80205 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otx1P80205 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otx1P80205 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otx1P80205 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Otx1P80205 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otx1P80205 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otx1P80205 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otx1P80205 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otx1P80205 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otx1P80205 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otx1P80205 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otx1P80205 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otx1P80205 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otx1P80205 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otx1P80205 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otx1P80205 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otx1P80205 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otx1P80205 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otx1P80205 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otx1P80205 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otx1P80205 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otx1P80205 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otx1P80205 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otx1P80205 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Otx1P80205 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Otx1P80205 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otx1P80205 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otx1P80205 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otx1P80205 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otx1P80205 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Otx1P80205 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Otx1P80205 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Otx1P80205 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otx1P80205 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otx1P80205 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otx1P80205 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otx1P80205 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Otx1P80205 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Otx1P80205 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Otx1P80205 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otx1P80205 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otx1P80205 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otx1P80205 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Otx1P80205 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Otx1P80205 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Otx1P80205 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Otx1P80205 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Otx1P80205 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Otx1P80205 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Otx1P80205 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Otx1P80205 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Otx1P80205 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otx1P80205 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otx1P80205 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otx1P80205 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otx1P80205 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otx1P80205 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otx1P80205 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otx1P80205 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otx1P80205 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Otx1P80205 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Otx1P80205 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms