Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ufd1P70362 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ufd1P70362 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ufd1P70362 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ufd1P70362 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ufd1P70362 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ufd1P70362 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ufd1P70362 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ufd1P70362 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ufd1P70362 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ufd1P70362 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ufd1P70362 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ufd1P70362 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ufd1P70362 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ufd1P70362 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ufd1P70362 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ufd1P70362 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ufd1P70362 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ufd1P70362 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ufd1P70362 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ufd1P70362 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ufd1P70362 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ufd1P70362 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ufd1P70362 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ufd1P70362 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ufd1P70362 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ufd1P70362 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ufd1P70362 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ufd1P70362 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ufd1P70362 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ufd1P70362 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ufd1P70362 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ufd1P70362 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ufd1P70362 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ufd1P70362 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ufd1P70362 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ufd1P70362 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ufd1P70362 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ufd1P70362 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ufd1P70362 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ufd1P70362 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ufd1P70362 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ufd1P70362 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ufd1P70362 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ufd1P70362 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ufd1P70362 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ufd1P70362 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ufd1P70362 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ufd1P70362 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ufd1P70362 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ufd1P70362 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ufd1P70362 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ufd1P70362 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ufd1P70362 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ufd1P70362 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ufd1P70362 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ufd1P70362 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ufd1P70362 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ufd1P70362 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ufd1P70362 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ufd1P70362 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ufd1P70362 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ufd1P70362 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ufd1P70362 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ufd1P70362 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ufd1P70362 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ufd1P70362 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ufd1P70362 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ufd1P70362 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ufd1P70362 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ufd1P70362 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ufd1P70362 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ufd1P70362 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ufd1P70362 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ufd1P70362 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ufd1P70362 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ufd1P70362 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ufd1P70362 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ufd1P70362 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ufd1P70362 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ufd1P70362 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ufd1P70362 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ufd1P70362 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ufd1P70362 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ufd1P70362 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ufd1P70362 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ufd1P70362 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ufd1P70362 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ufd1P70362 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ufd1P70362 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ufd1P70362 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ufd1P70362 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ufd1P70362 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ufd1P70362 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ufd1P70362 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ufd1P70362 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ufd1P70362 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ufd1P70362 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ufd1P70362 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ufd1P70362 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms