Protein–RNA interactions for Protein: P70190

Capza3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza3P70190 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Capza3P70190 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Capza3P70190 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Capza3P70190 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Capza3P70190 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Capza3P70190 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Capza3P70190 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Capza3P70190 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Capza3P70190 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Capza3P70190 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Capza3P70190 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Capza3P70190 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Capza3P70190 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Capza3P70190 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Capza3P70190 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Capza3P70190 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Capza3P70190 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Capza3P70190 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Capza3P70190 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Capza3P70190 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Capza3P70190 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Capza3P70190 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Capza3P70190 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Capza3P70190 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Capza3P70190 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Capza3P70190 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Capza3P70190 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Capza3P70190 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Capza3P70190 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Capza3P70190 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Capza3P70190 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Capza3P70190 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Capza3P70190 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Capza3P70190 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Capza3P70190 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Capza3P70190 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Capza3P70190 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Capza3P70190 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Capza3P70190 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Capza3P70190 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Capza3P70190 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Capza3P70190 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Capza3P70190 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Capza3P70190 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Capza3P70190 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Capza3P70190 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Capza3P70190 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Capza3P70190 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Capza3P70190 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Capza3P70190 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Capza3P70190 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Capza3P70190 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Capza3P70190 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Capza3P70190 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Capza3P70190 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Capza3P70190 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Capza3P70190 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Capza3P70190 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Capza3P70190 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Capza3P70190 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Capza3P70190 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Capza3P70190 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Capza3P70190 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Capza3P70190 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Capza3P70190 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Capza3P70190 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Capza3P70190 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Capza3P70190 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Capza3P70190 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Capza3P70190 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Capza3P70190 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Capza3P70190 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Capza3P70190 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Capza3P70190 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Capza3P70190 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Capza3P70190 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Capza3P70190 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Capza3P70190 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Capza3P70190 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Capza3P70190 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Capza3P70190 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Capza3P70190 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Capza3P70190 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Capza3P70190 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Capza3P70190 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Capza3P70190 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Capza3P70190 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Capza3P70190 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Capza3P70190 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Capza3P70190 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Capza3P70190 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Capza3P70190 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Capza3P70190 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Capza3P70190 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Capza3P70190 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Capza3P70190 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Capza3P70190 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Capza3P70190 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Capza3P70190 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Capza3P70190 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms