Protein–RNA interactions for Protein: P70158

Smpdl3a, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3aP70158 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Smpdl3aP70158 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smpdl3aP70158 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smpdl3aP70158 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smpdl3aP70158 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smpdl3aP70158 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smpdl3aP70158 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smpdl3aP70158 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smpdl3aP70158 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smpdl3aP70158 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smpdl3aP70158 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smpdl3aP70158 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smpdl3aP70158 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Smpdl3aP70158 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smpdl3aP70158 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smpdl3aP70158 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smpdl3aP70158 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smpdl3aP70158 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smpdl3aP70158 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smpdl3aP70158 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smpdl3aP70158 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smpdl3aP70158 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smpdl3aP70158 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smpdl3aP70158 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smpdl3aP70158 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smpdl3aP70158 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smpdl3aP70158 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Smpdl3aP70158 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smpdl3aP70158 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smpdl3aP70158 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smpdl3aP70158 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smpdl3aP70158 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smpdl3aP70158 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smpdl3aP70158 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smpdl3aP70158 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smpdl3aP70158 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smpdl3aP70158 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smpdl3aP70158 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smpdl3aP70158 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smpdl3aP70158 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smpdl3aP70158 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smpdl3aP70158 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Smpdl3aP70158 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Smpdl3aP70158 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smpdl3aP70158 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smpdl3aP70158 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smpdl3aP70158 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smpdl3aP70158 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smpdl3aP70158 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smpdl3aP70158 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smpdl3aP70158 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smpdl3aP70158 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smpdl3aP70158 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smpdl3aP70158 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smpdl3aP70158 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smpdl3aP70158 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smpdl3aP70158 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smpdl3aP70158 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smpdl3aP70158 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smpdl3aP70158 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smpdl3aP70158 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smpdl3aP70158 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smpdl3aP70158 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smpdl3aP70158 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smpdl3aP70158 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smpdl3aP70158 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smpdl3aP70158 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smpdl3aP70158 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smpdl3aP70158 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smpdl3aP70158 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Smpdl3aP70158 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smpdl3aP70158 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smpdl3aP70158 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smpdl3aP70158 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smpdl3aP70158 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smpdl3aP70158 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smpdl3aP70158 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smpdl3aP70158 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smpdl3aP70158 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smpdl3aP70158 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Smpdl3aP70158 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Smpdl3aP70158 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Smpdl3aP70158 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smpdl3aP70158 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smpdl3aP70158 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smpdl3aP70158 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Smpdl3aP70158 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smpdl3aP70158 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smpdl3aP70158 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smpdl3aP70158 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smpdl3aP70158 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smpdl3aP70158 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Smpdl3aP70158 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smpdl3aP70158 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smpdl3aP70158 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smpdl3aP70158 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smpdl3aP70158 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smpdl3aP70158 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smpdl3aP70158 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smpdl3aP70158 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.1 ms