Protein–RNA interactions for Protein: P63157

Barhl1, BarH-like 1 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl1P63157 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Barhl1P63157 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Barhl1P63157 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Barhl1P63157 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Barhl1P63157 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Barhl1P63157 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Barhl1P63157 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Barhl1P63157 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Barhl1P63157 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Barhl1P63157 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Barhl1P63157 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Barhl1P63157 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Barhl1P63157 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Barhl1P63157 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Barhl1P63157 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Barhl1P63157 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Barhl1P63157 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Barhl1P63157 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Barhl1P63157 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Barhl1P63157 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Barhl1P63157 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Barhl1P63157 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Barhl1P63157 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Barhl1P63157 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Barhl1P63157 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Barhl1P63157 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Barhl1P63157 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Barhl1P63157 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Barhl1P63157 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Barhl1P63157 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Barhl1P63157 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Barhl1P63157 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Barhl1P63157 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Barhl1P63157 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Barhl1P63157 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Barhl1P63157 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Barhl1P63157 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Barhl1P63157 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Barhl1P63157 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Barhl1P63157 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Barhl1P63157 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Barhl1P63157 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Barhl1P63157 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Barhl1P63157 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Barhl1P63157 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Barhl1P63157 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Barhl1P63157 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Barhl1P63157 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Barhl1P63157 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Barhl1P63157 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Barhl1P63157 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Barhl1P63157 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Barhl1P63157 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Barhl1P63157 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Barhl1P63157 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Barhl1P63157 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Barhl1P63157 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Barhl1P63157 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Barhl1P63157 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Barhl1P63157 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Barhl1P63157 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Barhl1P63157 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Barhl1P63157 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Barhl1P63157 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Barhl1P63157 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Barhl1P63157 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Barhl1P63157 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Barhl1P63157 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Barhl1P63157 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Barhl1P63157 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Barhl1P63157 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Barhl1P63157 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Barhl1P63157 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Barhl1P63157 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Barhl1P63157 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Barhl1P63157 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Barhl1P63157 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Barhl1P63157 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Barhl1P63157 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Barhl1P63157 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Barhl1P63157 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Barhl1P63157 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Barhl1P63157 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Barhl1P63157 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Barhl1P63157 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Barhl1P63157 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Barhl1P63157 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Barhl1P63157 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Barhl1P63157 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Barhl1P63157 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Barhl1P63157 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Barhl1P63157 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Barhl1P63157 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Barhl1P63157 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Barhl1P63157 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Barhl1P63157 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Barhl1P63157 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Barhl1P63157 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Barhl1P63157 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Barhl1P63157 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms