Protein–RNA interactions for Protein: P61793

Lpar1, Lysophosphatidic acid receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpar1P61793 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lpar1P61793 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lpar1P61793 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lpar1P61793 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lpar1P61793 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lpar1P61793 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lpar1P61793 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lpar1P61793 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lpar1P61793 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lpar1P61793 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lpar1P61793 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Lpar1P61793 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lpar1P61793 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lpar1P61793 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lpar1P61793 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lpar1P61793 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lpar1P61793 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lpar1P61793 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lpar1P61793 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lpar1P61793 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Lpar1P61793 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lpar1P61793 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lpar1P61793 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lpar1P61793 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lpar1P61793 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lpar1P61793 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lpar1P61793 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lpar1P61793 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lpar1P61793 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lpar1P61793 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lpar1P61793 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lpar1P61793 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lpar1P61793 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lpar1P61793 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Lpar1P61793 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lpar1P61793 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lpar1P61793 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lpar1P61793 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lpar1P61793 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lpar1P61793 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lpar1P61793 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Lpar1P61793 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Lpar1P61793 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lpar1P61793 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lpar1P61793 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lpar1P61793 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lpar1P61793 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lpar1P61793 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lpar1P61793 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lpar1P61793 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Lpar1P61793 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lpar1P61793 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lpar1P61793 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lpar1P61793 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lpar1P61793 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lpar1P61793 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lpar1P61793 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lpar1P61793 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lpar1P61793 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lpar1P61793 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lpar1P61793 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lpar1P61793 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lpar1P61793 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lpar1P61793 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lpar1P61793 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lpar1P61793 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lpar1P61793 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lpar1P61793 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lpar1P61793 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lpar1P61793 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lpar1P61793 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lpar1P61793 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lpar1P61793 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lpar1P61793 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lpar1P61793 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lpar1P61793 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lpar1P61793 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lpar1P61793 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lpar1P61793 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lpar1P61793 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lpar1P61793 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lpar1P61793 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lpar1P61793 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lpar1P61793 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lpar1P61793 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lpar1P61793 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lpar1P61793 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lpar1P61793 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lpar1P61793 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lpar1P61793 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lpar1P61793 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lpar1P61793 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lpar1P61793 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lpar1P61793 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Lpar1P61793 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lpar1P61793 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lpar1P61793 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lpar1P61793 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lpar1P61793 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lpar1P61793 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms