Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.56
Depdc5P61460 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
Depdc5P61460 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Depdc5P61460 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Depdc5P61460 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Depdc5P61460 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Depdc5P61460 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Depdc5P61460 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
Depdc5P61460 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Depdc5P61460 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Depdc5P61460 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
Depdc5P61460 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Depdc5P61460 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Depdc5P61460 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Depdc5P61460 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Depdc5P61460 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Depdc5P61460 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Depdc5P61460 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Depdc5P61460 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Depdc5P61460 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Depdc5P61460 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Depdc5P61460 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Depdc5P61460 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Depdc5P61460 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Depdc5P61460 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Depdc5P61460 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
Depdc5P61460 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Depdc5P61460 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Depdc5P61460 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Depdc5P61460 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Depdc5P61460 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Depdc5P61460 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
Depdc5P61460 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Depdc5P61460 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Depdc5P61460 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
Depdc5P61460 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Depdc5P61460 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Depdc5P61460 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Depdc5P61460 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Depdc5P61460 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Depdc5P61460 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Depdc5P61460 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Depdc5P61460 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Depdc5P61460 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Depdc5P61460 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Depdc5P61460 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Depdc5P61460 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Depdc5P61460 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Depdc5P61460 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Depdc5P61460 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
Depdc5P61460 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
Depdc5P61460 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Depdc5P61460 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Depdc5P61460 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Depdc5P61460 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Depdc5P61460 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Depdc5P61460 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Depdc5P61460 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
Depdc5P61460 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Depdc5P61460 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
Depdc5P61460 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Depdc5P61460 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Depdc5P61460 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Depdc5P61460 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
Depdc5P61460 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Depdc5P61460 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Depdc5P61460 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Depdc5P61460 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Depdc5P61460 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Depdc5P61460 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Depdc5P61460 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Depdc5P61460 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Depdc5P61460 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Depdc5P61460 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Depdc5P61460 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Depdc5P61460 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
Depdc5P61460 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Depdc5P61460 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Depdc5P61460 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Depdc5P61460 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Depdc5P61460 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
Depdc5P61460 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Depdc5P61460 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Depdc5P61460 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Depdc5P61460 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Depdc5P61460 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
Depdc5P61460 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Depdc5P61460 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Depdc5P61460 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Depdc5P61460 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Depdc5P61460 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Depdc5P61460 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Depdc5P61460 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Depdc5P61460 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Depdc5P61460 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Depdc5P61460 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Depdc5P61460 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
Depdc5P61460 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Depdc5P61460 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
Depdc5P61460 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms