Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arf3P61205 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arf3P61205 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arf3P61205 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arf3P61205 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arf3P61205 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Arf3P61205 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arf3P61205 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arf3P61205 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arf3P61205 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arf3P61205 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arf3P61205 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arf3P61205 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arf3P61205 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arf3P61205 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arf3P61205 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arf3P61205 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arf3P61205 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arf3P61205 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arf3P61205 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arf3P61205 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arf3P61205 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arf3P61205 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arf3P61205 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arf3P61205 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arf3P61205 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arf3P61205 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arf3P61205 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arf3P61205 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arf3P61205 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arf3P61205 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arf3P61205 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arf3P61205 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arf3P61205 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arf3P61205 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arf3P61205 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arf3P61205 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arf3P61205 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arf3P61205 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arf3P61205 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arf3P61205 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arf3P61205 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arf3P61205 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arf3P61205 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arf3P61205 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arf3P61205 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arf3P61205 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arf3P61205 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arf3P61205 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arf3P61205 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Arf3P61205 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arf3P61205 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arf3P61205 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arf3P61205 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arf3P61205 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arf3P61205 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arf3P61205 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arf3P61205 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arf3P61205 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arf3P61205 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arf3P61205 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arf3P61205 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arf3P61205 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arf3P61205 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arf3P61205 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arf3P61205 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arf3P61205 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arf3P61205 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Arf3P61205 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Arf3P61205 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Arf3P61205 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arf3P61205 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arf3P61205 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arf3P61205 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arf3P61205 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Arf3P61205 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arf3P61205 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arf3P61205 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arf3P61205 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arf3P61205 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arf3P61205 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arf3P61205 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arf3P61205 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arf3P61205 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arf3P61205 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arf3P61205 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arf3P61205 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arf3P61205 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arf3P61205 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arf3P61205 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arf3P61205 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arf3P61205 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arf3P61205 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arf3P61205 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arf3P61205 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arf3P61205 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Arf3P61205 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arf3P61205 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arf3P61205 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arf3P61205 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms