Protein–RNA interactions for Protein: P60334

Cdo1, Cysteine dioxygenase type 1, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdo1P60334 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdo1P60334 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdo1P60334 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdo1P60334 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdo1P60334 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdo1P60334 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdo1P60334 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdo1P60334 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdo1P60334 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdo1P60334 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdo1P60334 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdo1P60334 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdo1P60334 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdo1P60334 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdo1P60334 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdo1P60334 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdo1P60334 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdo1P60334 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdo1P60334 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdo1P60334 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cdo1P60334 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdo1P60334 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdo1P60334 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdo1P60334 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdo1P60334 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdo1P60334 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdo1P60334 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdo1P60334 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdo1P60334 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdo1P60334 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdo1P60334 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdo1P60334 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdo1P60334 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdo1P60334 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdo1P60334 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdo1P60334 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdo1P60334 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdo1P60334 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdo1P60334 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdo1P60334 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdo1P60334 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdo1P60334 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdo1P60334 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdo1P60334 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdo1P60334 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdo1P60334 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdo1P60334 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdo1P60334 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdo1P60334 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdo1P60334 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdo1P60334 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdo1P60334 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdo1P60334 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdo1P60334 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdo1P60334 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdo1P60334 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdo1P60334 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdo1P60334 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdo1P60334 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdo1P60334 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdo1P60334 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdo1P60334 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdo1P60334 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdo1P60334 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdo1P60334 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdo1P60334 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdo1P60334 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdo1P60334 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdo1P60334 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdo1P60334 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdo1P60334 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdo1P60334 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdo1P60334 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdo1P60334 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdo1P60334 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdo1P60334 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdo1P60334 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdo1P60334 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdo1P60334 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdo1P60334 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdo1P60334 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdo1P60334 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdo1P60334 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdo1P60334 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdo1P60334 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdo1P60334 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdo1P60334 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdo1P60334 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdo1P60334 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdo1P60334 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdo1P60334 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdo1P60334 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdo1P60334 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdo1P60334 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdo1P60334 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdo1P60334 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdo1P60334 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdo1P60334 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdo1P60334 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdo1P60334 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms