Protein–RNA interactions for Protein: P60330

Espl1, Separin, mousemouse

Predictions only

Length 2,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Espl1P60330 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Espl1P60330 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Espl1P60330 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Espl1P60330 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Espl1P60330 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Espl1P60330 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Espl1P60330 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Espl1P60330 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Espl1P60330 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Espl1P60330 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Espl1P60330 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Espl1P60330 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Espl1P60330 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Espl1P60330 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Espl1P60330 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Espl1P60330 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Espl1P60330 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Espl1P60330 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Espl1P60330 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Espl1P60330 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Espl1P60330 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Espl1P60330 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Espl1P60330 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Espl1P60330 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Espl1P60330 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Espl1P60330 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Espl1P60330 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Espl1P60330 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Espl1P60330 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Espl1P60330 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Espl1P60330 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Espl1P60330 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Espl1P60330 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Espl1P60330 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Espl1P60330 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Espl1P60330 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Espl1P60330 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Espl1P60330 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Espl1P60330 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Espl1P60330 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Espl1P60330 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Espl1P60330 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Espl1P60330 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Espl1P60330 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Espl1P60330 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Espl1P60330 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Espl1P60330 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Espl1P60330 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Espl1P60330 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Espl1P60330 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Espl1P60330 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Espl1P60330 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Espl1P60330 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Espl1P60330 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Espl1P60330 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Espl1P60330 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Espl1P60330 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Espl1P60330 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Espl1P60330 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Espl1P60330 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Espl1P60330 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Espl1P60330 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Espl1P60330 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Espl1P60330 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Espl1P60330 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Espl1P60330 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Espl1P60330 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Espl1P60330 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Espl1P60330 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Espl1P60330 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Espl1P60330 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Espl1P60330 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Espl1P60330 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Espl1P60330 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Espl1P60330 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Espl1P60330 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Espl1P60330 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Espl1P60330 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Espl1P60330 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Espl1P60330 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Espl1P60330 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Espl1P60330 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Espl1P60330 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Espl1P60330 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Espl1P60330 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Espl1P60330 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Espl1P60330 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Espl1P60330 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Espl1P60330 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Espl1P60330 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Espl1P60330 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Espl1P60330 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Espl1P60330 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Espl1P60330 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Espl1P60330 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Espl1P60330 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Espl1P60330 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Espl1P60330 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Espl1P60330 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Espl1P60330 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms