Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Paxbp1P58501 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Paxbp1P58501 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Paxbp1P58501 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Paxbp1P58501 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Paxbp1P58501 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Paxbp1P58501 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Paxbp1P58501 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Paxbp1P58501 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Paxbp1P58501 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Paxbp1P58501 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Paxbp1P58501 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Paxbp1P58501 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Paxbp1P58501 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Paxbp1P58501 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Paxbp1P58501 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Paxbp1P58501 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Paxbp1P58501 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Paxbp1P58501 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Paxbp1P58501 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Paxbp1P58501 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Paxbp1P58501 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Paxbp1P58501 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Paxbp1P58501 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Paxbp1P58501 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Paxbp1P58501 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Paxbp1P58501 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Paxbp1P58501 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Paxbp1P58501 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Paxbp1P58501 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Paxbp1P58501 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Paxbp1P58501 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Paxbp1P58501 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Paxbp1P58501 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Paxbp1P58501 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Paxbp1P58501 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Paxbp1P58501 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Paxbp1P58501 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Paxbp1P58501 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Paxbp1P58501 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Paxbp1P58501 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Paxbp1P58501 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Paxbp1P58501 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Paxbp1P58501 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Paxbp1P58501 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Paxbp1P58501 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Paxbp1P58501 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Paxbp1P58501 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Paxbp1P58501 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Paxbp1P58501 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Paxbp1P58501 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Paxbp1P58501 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Paxbp1P58501 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Paxbp1P58501 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Paxbp1P58501 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Paxbp1P58501 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Paxbp1P58501 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Paxbp1P58501 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Paxbp1P58501 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Paxbp1P58501 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Paxbp1P58501 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Paxbp1P58501 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Paxbp1P58501 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Paxbp1P58501 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Paxbp1P58501 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Paxbp1P58501 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Paxbp1P58501 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Paxbp1P58501 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Paxbp1P58501 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Paxbp1P58501 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Paxbp1P58501 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Paxbp1P58501 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Paxbp1P58501 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Paxbp1P58501 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Paxbp1P58501 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Paxbp1P58501 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Paxbp1P58501 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Paxbp1P58501 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Paxbp1P58501 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Paxbp1P58501 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Paxbp1P58501 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Paxbp1P58501 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Paxbp1P58501 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Paxbp1P58501 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Paxbp1P58501 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Paxbp1P58501 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Paxbp1P58501 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Paxbp1P58501 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Paxbp1P58501 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Paxbp1P58501 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Paxbp1P58501 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Paxbp1P58501 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Paxbp1P58501 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Paxbp1P58501 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Paxbp1P58501 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Paxbp1P58501 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Paxbp1P58501 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Paxbp1P58501 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Paxbp1P58501 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Paxbp1P58501 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms