Protein–RNA interactions for Protein: P58334

Klf16, Krueppel-like factor 16, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf16P58334 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klf16P58334 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klf16P58334 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klf16P58334 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klf16P58334 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klf16P58334 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klf16P58334 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Klf16P58334 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klf16P58334 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klf16P58334 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klf16P58334 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klf16P58334 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klf16P58334 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klf16P58334 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klf16P58334 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Klf16P58334 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klf16P58334 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Klf16P58334 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klf16P58334 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klf16P58334 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klf16P58334 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klf16P58334 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klf16P58334 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klf16P58334 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klf16P58334 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klf16P58334 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klf16P58334 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klf16P58334 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klf16P58334 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klf16P58334 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klf16P58334 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klf16P58334 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klf16P58334 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klf16P58334 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klf16P58334 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klf16P58334 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klf16P58334 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klf16P58334 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klf16P58334 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klf16P58334 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klf16P58334 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klf16P58334 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klf16P58334 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klf16P58334 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klf16P58334 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klf16P58334 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klf16P58334 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klf16P58334 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klf16P58334 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klf16P58334 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klf16P58334 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klf16P58334 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klf16P58334 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klf16P58334 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klf16P58334 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klf16P58334 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klf16P58334 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klf16P58334 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klf16P58334 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klf16P58334 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klf16P58334 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klf16P58334 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klf16P58334 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klf16P58334 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klf16P58334 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klf16P58334 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klf16P58334 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klf16P58334 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klf16P58334 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klf16P58334 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klf16P58334 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klf16P58334 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klf16P58334 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klf16P58334 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klf16P58334 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klf16P58334 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klf16P58334 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klf16P58334 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klf16P58334 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klf16P58334 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klf16P58334 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klf16P58334 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klf16P58334 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klf16P58334 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Klf16P58334 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klf16P58334 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klf16P58334 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Klf16P58334 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klf16P58334 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Klf16P58334 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Klf16P58334 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Klf16P58334 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klf16P58334 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klf16P58334 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klf16P58334 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klf16P58334 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klf16P58334 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klf16P58334 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klf16P58334 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klf16P58334 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms