Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smpdl3bP58242 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smpdl3bP58242 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smpdl3bP58242 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smpdl3bP58242 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smpdl3bP58242 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smpdl3bP58242 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smpdl3bP58242 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smpdl3bP58242 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Smpdl3bP58242 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smpdl3bP58242 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smpdl3bP58242 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Smpdl3bP58242 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smpdl3bP58242 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smpdl3bP58242 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smpdl3bP58242 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smpdl3bP58242 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Smpdl3bP58242 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smpdl3bP58242 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smpdl3bP58242 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smpdl3bP58242 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smpdl3bP58242 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smpdl3bP58242 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smpdl3bP58242 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smpdl3bP58242 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smpdl3bP58242 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smpdl3bP58242 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smpdl3bP58242 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smpdl3bP58242 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smpdl3bP58242 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smpdl3bP58242 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smpdl3bP58242 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smpdl3bP58242 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smpdl3bP58242 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smpdl3bP58242 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smpdl3bP58242 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smpdl3bP58242 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smpdl3bP58242 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smpdl3bP58242 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smpdl3bP58242 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smpdl3bP58242 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smpdl3bP58242 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smpdl3bP58242 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smpdl3bP58242 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smpdl3bP58242 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smpdl3bP58242 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smpdl3bP58242 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smpdl3bP58242 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smpdl3bP58242 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smpdl3bP58242 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smpdl3bP58242 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smpdl3bP58242 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smpdl3bP58242 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smpdl3bP58242 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smpdl3bP58242 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smpdl3bP58242 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smpdl3bP58242 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smpdl3bP58242 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smpdl3bP58242 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smpdl3bP58242 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Smpdl3bP58242 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smpdl3bP58242 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smpdl3bP58242 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smpdl3bP58242 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smpdl3bP58242 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smpdl3bP58242 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smpdl3bP58242 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smpdl3bP58242 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smpdl3bP58242 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smpdl3bP58242 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smpdl3bP58242 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smpdl3bP58242 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smpdl3bP58242 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smpdl3bP58242 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smpdl3bP58242 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smpdl3bP58242 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smpdl3bP58242 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smpdl3bP58242 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smpdl3bP58242 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smpdl3bP58242 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smpdl3bP58242 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smpdl3bP58242 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smpdl3bP58242 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smpdl3bP58242 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smpdl3bP58242 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smpdl3bP58242 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smpdl3bP58242 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smpdl3bP58242 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smpdl3bP58242 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smpdl3bP58242 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smpdl3bP58242 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smpdl3bP58242 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smpdl3bP58242 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smpdl3bP58242 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smpdl3bP58242 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smpdl3bP58242 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smpdl3bP58242 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smpdl3bP58242 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smpdl3bP58242 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smpdl3bP58242 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms