Protein–RNA interactions for Protein: P56845

Tcl1b5, Protein TCL1B5, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcl1b5P56845 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcl1b5P56845 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcl1b5P56845 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcl1b5P56845 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcl1b5P56845 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcl1b5P56845 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcl1b5P56845 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcl1b5P56845 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcl1b5P56845 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcl1b5P56845 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcl1b5P56845 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcl1b5P56845 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tcl1b5P56845 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcl1b5P56845 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcl1b5P56845 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcl1b5P56845 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcl1b5P56845 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcl1b5P56845 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcl1b5P56845 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcl1b5P56845 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcl1b5P56845 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcl1b5P56845 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcl1b5P56845 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcl1b5P56845 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcl1b5P56845 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcl1b5P56845 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcl1b5P56845 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcl1b5P56845 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcl1b5P56845 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcl1b5P56845 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcl1b5P56845 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tcl1b5P56845 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcl1b5P56845 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcl1b5P56845 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tcl1b5P56845 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcl1b5P56845 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcl1b5P56845 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcl1b5P56845 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcl1b5P56845 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcl1b5P56845 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcl1b5P56845 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcl1b5P56845 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcl1b5P56845 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcl1b5P56845 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcl1b5P56845 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcl1b5P56845 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcl1b5P56845 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcl1b5P56845 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcl1b5P56845 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tcl1b5P56845 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tcl1b5P56845 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tcl1b5P56845 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tcl1b5P56845 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tcl1b5P56845 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tcl1b5P56845 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tcl1b5P56845 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tcl1b5P56845 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tcl1b5P56845 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tcl1b5P56845 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tcl1b5P56845 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tcl1b5P56845 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tcl1b5P56845 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tcl1b5P56845 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tcl1b5P56845 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tcl1b5P56845 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tcl1b5P56845 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tcl1b5P56845 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tcl1b5P56845 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcl1b5P56845 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcl1b5P56845 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcl1b5P56845 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcl1b5P56845 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcl1b5P56845 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcl1b5P56845 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcl1b5P56845 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcl1b5P56845 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcl1b5P56845 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcl1b5P56845 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcl1b5P56845 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcl1b5P56845 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcl1b5P56845 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcl1b5P56845 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcl1b5P56845 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcl1b5P56845 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcl1b5P56845 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcl1b5P56845 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcl1b5P56845 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcl1b5P56845 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcl1b5P56845 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcl1b5P56845 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcl1b5P56845 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcl1b5P56845 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcl1b5P56845 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcl1b5P56845 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcl1b5P56845 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcl1b5P56845 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcl1b5P56845 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcl1b5P56845 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcl1b5P56845 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcl1b5P56845 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 207.5 ms