Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CartptP56388 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CartptP56388 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CartptP56388 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CartptP56388 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CartptP56388 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CartptP56388 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CartptP56388 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CartptP56388 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CartptP56388 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CartptP56388 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CartptP56388 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CartptP56388 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CartptP56388 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CartptP56388 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CartptP56388 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CartptP56388 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CartptP56388 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CartptP56388 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CartptP56388 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CartptP56388 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CartptP56388 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CartptP56388 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CartptP56388 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CartptP56388 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CartptP56388 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CartptP56388 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CartptP56388 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CartptP56388 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CartptP56388 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CartptP56388 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CartptP56388 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CartptP56388 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CartptP56388 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CartptP56388 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CartptP56388 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CartptP56388 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CartptP56388 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CartptP56388 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CartptP56388 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CartptP56388 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CartptP56388 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CartptP56388 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CartptP56388 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CartptP56388 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CartptP56388 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CartptP56388 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CartptP56388 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CartptP56388 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CartptP56388 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CartptP56388 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CartptP56388 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CartptP56388 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CartptP56388 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CartptP56388 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CartptP56388 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CartptP56388 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CartptP56388 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CartptP56388 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CartptP56388 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CartptP56388 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CartptP56388 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CartptP56388 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CartptP56388 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CartptP56388 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CartptP56388 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CartptP56388 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CartptP56388 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CartptP56388 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CartptP56388 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CartptP56388 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CartptP56388 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CartptP56388 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CartptP56388 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CartptP56388 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CartptP56388 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CartptP56388 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CartptP56388 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CartptP56388 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CartptP56388 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CartptP56388 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CartptP56388 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CartptP56388 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CartptP56388 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CartptP56388 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CartptP56388 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CartptP56388 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CartptP56388 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CartptP56388 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CartptP56388 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CartptP56388 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CartptP56388 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CartptP56388 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CartptP56388 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CartptP56388 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CartptP56388 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CartptP56388 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CartptP56388 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CartptP56388 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CartptP56388 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms