Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rrp1P56183 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rrp1P56183 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rrp1P56183 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rrp1P56183 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rrp1P56183 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rrp1P56183 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rrp1P56183 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rrp1P56183 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rrp1P56183 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rrp1P56183 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rrp1P56183 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rrp1P56183 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rrp1P56183 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rrp1P56183 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rrp1P56183 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rrp1P56183 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rrp1P56183 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rrp1P56183 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Rrp1P56183 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rrp1P56183 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rrp1P56183 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rrp1P56183 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rrp1P56183 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rrp1P56183 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Rrp1P56183 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rrp1P56183 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rrp1P56183 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rrp1P56183 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rrp1P56183 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rrp1P56183 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rrp1P56183 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rrp1P56183 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rrp1P56183 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rrp1P56183 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rrp1P56183 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rrp1P56183 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rrp1P56183 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rrp1P56183 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rrp1P56183 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rrp1P56183 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rrp1P56183 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rrp1P56183 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rrp1P56183 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rrp1P56183 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rrp1P56183 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rrp1P56183 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rrp1P56183 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rrp1P56183 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rrp1P56183 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rrp1P56183 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rrp1P56183 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rrp1P56183 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rrp1P56183 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rrp1P56183 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rrp1P56183 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rrp1P56183 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rrp1P56183 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rrp1P56183 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rrp1P56183 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rrp1P56183 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rrp1P56183 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rrp1P56183 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rrp1P56183 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rrp1P56183 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rrp1P56183 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rrp1P56183 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Rrp1P56183 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Rrp1P56183 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rrp1P56183 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rrp1P56183 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rrp1P56183 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rrp1P56183 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rrp1P56183 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rrp1P56183 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rrp1P56183 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rrp1P56183 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rrp1P56183 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rrp1P56183 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rrp1P56183 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rrp1P56183 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rrp1P56183 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rrp1P56183 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rrp1P56183 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rrp1P56183 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rrp1P56183 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rrp1P56183 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rrp1P56183 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rrp1P56183 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rrp1P56183 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Rrp1P56183 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rrp1P56183 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rrp1P56183 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rrp1P56183 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rrp1P56183 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rrp1P56183 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rrp1P56183 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rrp1P56183 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rrp1P56183 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rrp1P56183 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms