Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GemP55041 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GemP55041 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GemP55041 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GemP55041 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GemP55041 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GemP55041 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GemP55041 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GemP55041 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GemP55041 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GemP55041 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GemP55041 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GemP55041 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GemP55041 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GemP55041 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GemP55041 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GemP55041 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GemP55041 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GemP55041 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GemP55041 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GemP55041 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GemP55041 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GemP55041 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GemP55041 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GemP55041 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GemP55041 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GemP55041 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GemP55041 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GemP55041 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GemP55041 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GemP55041 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GemP55041 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GemP55041 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GemP55041 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GemP55041 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GemP55041 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GemP55041 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GemP55041 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GemP55041 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GemP55041 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GemP55041 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GemP55041 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GemP55041 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GemP55041 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GemP55041 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GemP55041 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GemP55041 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GemP55041 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GemP55041 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GemP55041 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GemP55041 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GemP55041 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GemP55041 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GemP55041 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GemP55041 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GemP55041 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GemP55041 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GemP55041 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GemP55041 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GemP55041 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GemP55041 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GemP55041 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GemP55041 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GemP55041 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GemP55041 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GemP55041 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GemP55041 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GemP55041 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GemP55041 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GemP55041 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GemP55041 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GemP55041 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GemP55041 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GemP55041 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GemP55041 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GemP55041 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GemP55041 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GemP55041 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GemP55041 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GemP55041 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GemP55041 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GemP55041 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GemP55041 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GemP55041 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GemP55041 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GemP55041 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GemP55041 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GemP55041 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GemP55041 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GemP55041 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GemP55041 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GemP55041 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GemP55041 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GemP55041 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GemP55041 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GemP55041 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GemP55041 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GemP55041 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GemP55041 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GemP55041 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms