Protein–RNA interactions for Protein: P54227

Stmn1, Stathmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stmn1P54227 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stmn1P54227 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stmn1P54227 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stmn1P54227 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stmn1P54227 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stmn1P54227 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stmn1P54227 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stmn1P54227 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stmn1P54227 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stmn1P54227 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stmn1P54227 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stmn1P54227 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stmn1P54227 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Stmn1P54227 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Stmn1P54227 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stmn1P54227 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stmn1P54227 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stmn1P54227 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stmn1P54227 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stmn1P54227 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stmn1P54227 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stmn1P54227 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stmn1P54227 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stmn1P54227 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stmn1P54227 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stmn1P54227 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stmn1P54227 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stmn1P54227 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stmn1P54227 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stmn1P54227 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stmn1P54227 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stmn1P54227 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stmn1P54227 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stmn1P54227 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stmn1P54227 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Stmn1P54227 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stmn1P54227 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stmn1P54227 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stmn1P54227 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stmn1P54227 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stmn1P54227 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Stmn1P54227 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stmn1P54227 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stmn1P54227 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stmn1P54227 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stmn1P54227 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stmn1P54227 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stmn1P54227 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stmn1P54227 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stmn1P54227 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stmn1P54227 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stmn1P54227 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stmn1P54227 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stmn1P54227 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stmn1P54227 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stmn1P54227 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stmn1P54227 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stmn1P54227 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stmn1P54227 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stmn1P54227 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stmn1P54227 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stmn1P54227 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stmn1P54227 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stmn1P54227 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stmn1P54227 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stmn1P54227 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stmn1P54227 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stmn1P54227 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stmn1P54227 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stmn1P54227 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stmn1P54227 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stmn1P54227 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stmn1P54227 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stmn1P54227 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stmn1P54227 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stmn1P54227 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stmn1P54227 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stmn1P54227 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stmn1P54227 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stmn1P54227 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stmn1P54227 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stmn1P54227 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stmn1P54227 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stmn1P54227 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Stmn1P54227 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stmn1P54227 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stmn1P54227 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stmn1P54227 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stmn1P54227 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stmn1P54227 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stmn1P54227 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stmn1P54227 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stmn1P54227 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stmn1P54227 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stmn1P54227 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stmn1P54227 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stmn1P54227 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stmn1P54227 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stmn1P54227 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stmn1P54227 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms