Protein–RNA interactions for Protein: P54099

Polg, DNA polymerase subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolgP54099 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PolgP54099 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PolgP54099 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PolgP54099 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PolgP54099 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PolgP54099 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PolgP54099 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PolgP54099 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PolgP54099 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PolgP54099 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PolgP54099 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PolgP54099 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PolgP54099 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PolgP54099 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PolgP54099 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PolgP54099 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PolgP54099 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PolgP54099 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PolgP54099 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PolgP54099 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PolgP54099 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PolgP54099 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PolgP54099 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PolgP54099 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PolgP54099 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PolgP54099 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PolgP54099 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PolgP54099 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PolgP54099 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PolgP54099 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PolgP54099 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PolgP54099 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PolgP54099 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PolgP54099 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PolgP54099 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PolgP54099 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PolgP54099 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PolgP54099 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PolgP54099 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PolgP54099 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PolgP54099 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PolgP54099 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PolgP54099 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PolgP54099 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PolgP54099 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PolgP54099 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PolgP54099 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PolgP54099 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PolgP54099 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PolgP54099 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PolgP54099 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PolgP54099 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PolgP54099 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PolgP54099 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PolgP54099 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PolgP54099 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PolgP54099 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PolgP54099 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PolgP54099 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PolgP54099 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PolgP54099 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PolgP54099 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PolgP54099 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PolgP54099 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PolgP54099 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PolgP54099 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PolgP54099 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PolgP54099 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PolgP54099 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PolgP54099 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PolgP54099 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PolgP54099 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PolgP54099 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PolgP54099 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PolgP54099 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PolgP54099 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PolgP54099 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PolgP54099 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PolgP54099 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PolgP54099 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PolgP54099 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PolgP54099 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PolgP54099 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PolgP54099 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PolgP54099 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PolgP54099 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PolgP54099 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PolgP54099 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PolgP54099 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PolgP54099 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PolgP54099 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PolgP54099 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PolgP54099 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PolgP54099 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PolgP54099 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PolgP54099 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PolgP54099 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PolgP54099 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PolgP54099 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PolgP54099 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms