Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dbx1P52950 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dbx1P52950 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dbx1P52950 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dbx1P52950 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Dbx1P52950 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dbx1P52950 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dbx1P52950 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dbx1P52950 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dbx1P52950 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dbx1P52950 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dbx1P52950 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dbx1P52950 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dbx1P52950 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dbx1P52950 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dbx1P52950 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dbx1P52950 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dbx1P52950 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Dbx1P52950 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dbx1P52950 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dbx1P52950 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dbx1P52950 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dbx1P52950 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dbx1P52950 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dbx1P52950 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dbx1P52950 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dbx1P52950 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dbx1P52950 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dbx1P52950 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Dbx1P52950 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dbx1P52950 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dbx1P52950 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dbx1P52950 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Dbx1P52950 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dbx1P52950 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dbx1P52950 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dbx1P52950 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dbx1P52950 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dbx1P52950 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dbx1P52950 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dbx1P52950 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dbx1P52950 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dbx1P52950 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dbx1P52950 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dbx1P52950 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dbx1P52950 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dbx1P52950 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dbx1P52950 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dbx1P52950 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dbx1P52950 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dbx1P52950 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dbx1P52950 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dbx1P52950 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dbx1P52950 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dbx1P52950 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dbx1P52950 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dbx1P52950 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dbx1P52950 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dbx1P52950 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dbx1P52950 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dbx1P52950 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dbx1P52950 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dbx1P52950 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dbx1P52950 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dbx1P52950 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dbx1P52950 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dbx1P52950 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dbx1P52950 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dbx1P52950 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dbx1P52950 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dbx1P52950 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dbx1P52950 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dbx1P52950 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dbx1P52950 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Dbx1P52950 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dbx1P52950 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dbx1P52950 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dbx1P52950 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dbx1P52950 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dbx1P52950 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dbx1P52950 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dbx1P52950 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dbx1P52950 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dbx1P52950 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dbx1P52950 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dbx1P52950 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dbx1P52950 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dbx1P52950 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dbx1P52950 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Dbx1P52950 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dbx1P52950 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Dbx1P52950 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dbx1P52950 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dbx1P52950 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dbx1P52950 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dbx1P52950 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dbx1P52950 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Dbx1P52950 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dbx1P52950 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Dbx1P52950 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms