Protein–RNA interactions for Protein: P52793

Efna1, Ephrin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna1P52793 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efna1P52793 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efna1P52793 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efna1P52793 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efna1P52793 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efna1P52793 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efna1P52793 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efna1P52793 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efna1P52793 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efna1P52793 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efna1P52793 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efna1P52793 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efna1P52793 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efna1P52793 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efna1P52793 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Efna1P52793 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Efna1P52793 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Efna1P52793 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Efna1P52793 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Efna1P52793 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Efna1P52793 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efna1P52793 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efna1P52793 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efna1P52793 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efna1P52793 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efna1P52793 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efna1P52793 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efna1P52793 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efna1P52793 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efna1P52793 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Efna1P52793 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Efna1P52793 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Efna1P52793 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Efna1P52793 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Efna1P52793 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Efna1P52793 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Efna1P52793 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Efna1P52793 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Efna1P52793 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efna1P52793 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efna1P52793 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Efna1P52793 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Efna1P52793 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Efna1P52793 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Efna1P52793 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Efna1P52793 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Efna1P52793 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Efna1P52793 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Efna1P52793 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Efna1P52793 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Efna1P52793 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Efna1P52793 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Efna1P52793 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Efna1P52793 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Efna1P52793 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efna1P52793 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efna1P52793 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efna1P52793 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Efna1P52793 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Efna1P52793 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Efna1P52793 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Efna1P52793 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Efna1P52793 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Efna1P52793 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Efna1P52793 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Efna1P52793 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Efna1P52793 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Efna1P52793 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Efna1P52793 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Efna1P52793 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Efna1P52793 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Efna1P52793 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Efna1P52793 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efna1P52793 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efna1P52793 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efna1P52793 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Efna1P52793 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efna1P52793 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efna1P52793 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efna1P52793 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efna1P52793 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efna1P52793 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efna1P52793 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efna1P52793 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efna1P52793 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efna1P52793 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Efna1P52793 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efna1P52793 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efna1P52793 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efna1P52793 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efna1P52793 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efna1P52793 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efna1P52793 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efna1P52793 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efna1P52793 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efna1P52793 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efna1P52793 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efna1P52793 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efna1P52793 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efna1P52793 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms