Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Upp1P52624 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Upp1P52624 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Upp1P52624 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Upp1P52624 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Upp1P52624 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Upp1P52624 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Upp1P52624 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Upp1P52624 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Upp1P52624 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Upp1P52624 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Upp1P52624 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Upp1P52624 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Upp1P52624 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Upp1P52624 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Upp1P52624 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Upp1P52624 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Upp1P52624 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Upp1P52624 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Upp1P52624 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Upp1P52624 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Upp1P52624 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Upp1P52624 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Upp1P52624 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Upp1P52624 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Upp1P52624 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Upp1P52624 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Upp1P52624 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Upp1P52624 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Upp1P52624 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Upp1P52624 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Upp1P52624 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Upp1P52624 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Upp1P52624 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Upp1P52624 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Upp1P52624 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Upp1P52624 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Upp1P52624 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Upp1P52624 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Upp1P52624 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Upp1P52624 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Upp1P52624 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Upp1P52624 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Upp1P52624 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Upp1P52624 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Upp1P52624 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Upp1P52624 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Upp1P52624 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Upp1P52624 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Upp1P52624 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Upp1P52624 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Upp1P52624 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Upp1P52624 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Upp1P52624 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Upp1P52624 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Upp1P52624 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Upp1P52624 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Upp1P52624 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Upp1P52624 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Upp1P52624 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Upp1P52624 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Upp1P52624 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Upp1P52624 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Upp1P52624 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Upp1P52624 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Upp1P52624 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Upp1P52624 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Upp1P52624 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Upp1P52624 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Upp1P52624 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Upp1P52624 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Upp1P52624 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Upp1P52624 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Upp1P52624 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Upp1P52624 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Upp1P52624 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Upp1P52624 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Upp1P52624 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Upp1P52624 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Upp1P52624 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Upp1P52624 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Upp1P52624 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Upp1P52624 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Upp1P52624 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Upp1P52624 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Upp1P52624 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Upp1P52624 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Upp1P52624 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Upp1P52624 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Upp1P52624 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Upp1P52624 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Upp1P52624 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Upp1P52624 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Upp1P52624 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Upp1P52624 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Upp1P52624 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Upp1P52624 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Upp1P52624 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Upp1P52624 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Upp1P52624 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 283.2 ms