Protein–RNA interactions for Protein: P51906

Slc1a1, Excitatory amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a1P51906 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc1a1P51906 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc1a1P51906 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc1a1P51906 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Slc1a1P51906 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Slc1a1P51906 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc1a1P51906 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc1a1P51906 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc1a1P51906 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc1a1P51906 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc1a1P51906 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc1a1P51906 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc1a1P51906 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc1a1P51906 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc1a1P51906 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc1a1P51906 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc1a1P51906 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc1a1P51906 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc1a1P51906 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc1a1P51906 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc1a1P51906 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc1a1P51906 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc1a1P51906 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc1a1P51906 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc1a1P51906 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc1a1P51906 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc1a1P51906 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc1a1P51906 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc1a1P51906 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc1a1P51906 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc1a1P51906 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc1a1P51906 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc1a1P51906 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc1a1P51906 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc1a1P51906 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc1a1P51906 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc1a1P51906 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc1a1P51906 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc1a1P51906 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc1a1P51906 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc1a1P51906 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc1a1P51906 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc1a1P51906 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc1a1P51906 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc1a1P51906 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc1a1P51906 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc1a1P51906 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc1a1P51906 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc1a1P51906 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc1a1P51906 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc1a1P51906 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc1a1P51906 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc1a1P51906 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc1a1P51906 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Slc1a1P51906 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc1a1P51906 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc1a1P51906 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc1a1P51906 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc1a1P51906 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc1a1P51906 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc1a1P51906 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc1a1P51906 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc1a1P51906 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc1a1P51906 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc1a1P51906 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc1a1P51906 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc1a1P51906 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc1a1P51906 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc1a1P51906 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc1a1P51906 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc1a1P51906 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc1a1P51906 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc1a1P51906 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc1a1P51906 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc1a1P51906 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc1a1P51906 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc1a1P51906 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc1a1P51906 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc1a1P51906 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc1a1P51906 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc1a1P51906 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc1a1P51906 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc1a1P51906 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc1a1P51906 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc1a1P51906 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc1a1P51906 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc1a1P51906 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc1a1P51906 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc1a1P51906 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc1a1P51906 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc1a1P51906 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc1a1P51906 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc1a1P51906 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc1a1P51906 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc1a1P51906 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc1a1P51906 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc1a1P51906 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc1a1P51906 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc1a1P51906 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc1a1P51906 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms