Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccr4P51680 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccr4P51680 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccr4P51680 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccr4P51680 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccr4P51680 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccr4P51680 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccr4P51680 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccr4P51680 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccr4P51680 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccr4P51680 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccr4P51680 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccr4P51680 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccr4P51680 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccr4P51680 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccr4P51680 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccr4P51680 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccr4P51680 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccr4P51680 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccr4P51680 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccr4P51680 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccr4P51680 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccr4P51680 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccr4P51680 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccr4P51680 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccr4P51680 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccr4P51680 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccr4P51680 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccr4P51680 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccr4P51680 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccr4P51680 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccr4P51680 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccr4P51680 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccr4P51680 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccr4P51680 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccr4P51680 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccr4P51680 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccr4P51680 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccr4P51680 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccr4P51680 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccr4P51680 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccr4P51680 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccr4P51680 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccr4P51680 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccr4P51680 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccr4P51680 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccr4P51680 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccr4P51680 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccr4P51680 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccr4P51680 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccr4P51680 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccr4P51680 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccr4P51680 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccr4P51680 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccr4P51680 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccr4P51680 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccr4P51680 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccr4P51680 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccr4P51680 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccr4P51680 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccr4P51680 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccr4P51680 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccr4P51680 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccr4P51680 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccr4P51680 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccr4P51680 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccr4P51680 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccr4P51680 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccr4P51680 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccr4P51680 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccr4P51680 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccr4P51680 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccr4P51680 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccr4P51680 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccr4P51680 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccr4P51680 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccr4P51680 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccr4P51680 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccr4P51680 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccr4P51680 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccr4P51680 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccr4P51680 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccr4P51680 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccr4P51680 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccr4P51680 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccr4P51680 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccr4P51680 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccr4P51680 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccr4P51680 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccr4P51680 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccr4P51680 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccr4P51680 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccr4P51680 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccr4P51680 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccr4P51680 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccr4P51680 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccr4P51680 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccr4P51680 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccr4P51680 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccr4P51680 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms