Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FanccP50652 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FanccP50652 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FanccP50652 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FanccP50652 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FanccP50652 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FanccP50652 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FanccP50652 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
FanccP50652 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
FanccP50652 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FanccP50652 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FanccP50652 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FanccP50652 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FanccP50652 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FanccP50652 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FanccP50652 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FanccP50652 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FanccP50652 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FanccP50652 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FanccP50652 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FanccP50652 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FanccP50652 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FanccP50652 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
FanccP50652 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FanccP50652 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FanccP50652 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FanccP50652 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FanccP50652 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FanccP50652 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FanccP50652 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FanccP50652 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FanccP50652 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FanccP50652 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FanccP50652 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FanccP50652 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
FanccP50652 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
FanccP50652 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FanccP50652 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FanccP50652 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FanccP50652 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FanccP50652 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FanccP50652 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FanccP50652 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FanccP50652 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FanccP50652 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FanccP50652 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FanccP50652 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FanccP50652 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FanccP50652 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FanccP50652 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FanccP50652 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
FanccP50652 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FanccP50652 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FanccP50652 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FanccP50652 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FanccP50652 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FanccP50652 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FanccP50652 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FanccP50652 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FanccP50652 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FanccP50652 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FanccP50652 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FanccP50652 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FanccP50652 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FanccP50652 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FanccP50652 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FanccP50652 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FanccP50652 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FanccP50652 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FanccP50652 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FanccP50652 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
FanccP50652 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FanccP50652 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FanccP50652 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FanccP50652 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FanccP50652 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FanccP50652 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
FanccP50652 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FanccP50652 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FanccP50652 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FanccP50652 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FanccP50652 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FanccP50652 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FanccP50652 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FanccP50652 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FanccP50652 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FanccP50652 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FanccP50652 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FanccP50652 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FanccP50652 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FanccP50652 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FanccP50652 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FanccP50652 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FanccP50652 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FanccP50652 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FanccP50652 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FanccP50652 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FanccP50652 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
FanccP50652 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FanccP50652 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms