Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TspoP50637 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TspoP50637 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TspoP50637 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TspoP50637 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TspoP50637 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TspoP50637 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TspoP50637 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TspoP50637 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TspoP50637 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TspoP50637 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TspoP50637 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TspoP50637 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TspoP50637 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TspoP50637 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TspoP50637 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TspoP50637 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TspoP50637 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TspoP50637 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TspoP50637 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TspoP50637 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TspoP50637 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TspoP50637 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TspoP50637 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TspoP50637 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TspoP50637 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TspoP50637 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TspoP50637 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TspoP50637 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TspoP50637 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TspoP50637 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TspoP50637 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TspoP50637 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TspoP50637 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TspoP50637 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TspoP50637 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TspoP50637 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TspoP50637 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TspoP50637 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TspoP50637 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TspoP50637 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TspoP50637 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TspoP50637 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TspoP50637 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TspoP50637 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TspoP50637 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TspoP50637 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TspoP50637 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TspoP50637 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TspoP50637 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TspoP50637 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TspoP50637 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TspoP50637 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TspoP50637 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TspoP50637 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TspoP50637 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TspoP50637 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TspoP50637 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TspoP50637 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TspoP50637 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TspoP50637 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TspoP50637 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TspoP50637 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TspoP50637 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TspoP50637 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TspoP50637 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TspoP50637 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TspoP50637 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TspoP50637 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TspoP50637 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TspoP50637 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TspoP50637 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TspoP50637 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TspoP50637 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TspoP50637 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TspoP50637 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TspoP50637 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TspoP50637 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TspoP50637 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TspoP50637 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TspoP50637 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TspoP50637 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TspoP50637 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TspoP50637 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TspoP50637 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TspoP50637 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TspoP50637 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TspoP50637 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TspoP50637 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TspoP50637 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TspoP50637 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TspoP50637 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TspoP50637 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TspoP50637 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TspoP50637 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TspoP50637 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TspoP50637 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TspoP50637 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TspoP50637 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TspoP50637 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms