Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
VegfbP49766 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VegfbP49766 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
VegfbP49766 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VegfbP49766 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VegfbP49766 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
VegfbP49766 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
VegfbP49766 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
VegfbP49766 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VegfbP49766 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VegfbP49766 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
VegfbP49766 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VegfbP49766 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VegfbP49766 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VegfbP49766 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
VegfbP49766 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VegfbP49766 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VegfbP49766 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VegfbP49766 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
VegfbP49766 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
VegfbP49766 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
VegfbP49766 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
VegfbP49766 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VegfbP49766 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
VegfbP49766 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
VegfbP49766 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VegfbP49766 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VegfbP49766 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
VegfbP49766 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VegfbP49766 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VegfbP49766 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VegfbP49766 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VegfbP49766 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VegfbP49766 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
VegfbP49766 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VegfbP49766 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VegfbP49766 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VegfbP49766 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VegfbP49766 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VegfbP49766 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VegfbP49766 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VegfbP49766 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VegfbP49766 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VegfbP49766 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VegfbP49766 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VegfbP49766 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VegfbP49766 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VegfbP49766 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VegfbP49766 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VegfbP49766 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VegfbP49766 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VegfbP49766 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VegfbP49766 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
VegfbP49766 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VegfbP49766 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
VegfbP49766 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
VegfbP49766 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VegfbP49766 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VegfbP49766 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VegfbP49766 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VegfbP49766 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VegfbP49766 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VegfbP49766 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VegfbP49766 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VegfbP49766 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VegfbP49766 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VegfbP49766 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VegfbP49766 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VegfbP49766 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VegfbP49766 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VegfbP49766 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
VegfbP49766 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VegfbP49766 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VegfbP49766 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
VegfbP49766 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VegfbP49766 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VegfbP49766 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VegfbP49766 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VegfbP49766 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VegfbP49766 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VegfbP49766 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VegfbP49766 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VegfbP49766 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VegfbP49766 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VegfbP49766 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VegfbP49766 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VegfbP49766 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VegfbP49766 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
VegfbP49766 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
VegfbP49766 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VegfbP49766 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VegfbP49766 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
VegfbP49766 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
VegfbP49766 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VegfbP49766 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VegfbP49766 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
VegfbP49766 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VegfbP49766 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VegfbP49766 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VegfbP49766 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms