Protein–RNA interactions for Protein: P49660

Sstr4, Somatostatin receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sstr4P49660 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sstr4P49660 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sstr4P49660 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sstr4P49660 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sstr4P49660 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sstr4P49660 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sstr4P49660 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sstr4P49660 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sstr4P49660 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sstr4P49660 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sstr4P49660 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sstr4P49660 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sstr4P49660 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sstr4P49660 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sstr4P49660 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sstr4P49660 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sstr4P49660 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sstr4P49660 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sstr4P49660 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sstr4P49660 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sstr4P49660 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sstr4P49660 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sstr4P49660 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sstr4P49660 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sstr4P49660 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sstr4P49660 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sstr4P49660 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sstr4P49660 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sstr4P49660 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sstr4P49660 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sstr4P49660 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sstr4P49660 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sstr4P49660 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sstr4P49660 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sstr4P49660 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sstr4P49660 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sstr4P49660 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sstr4P49660 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sstr4P49660 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sstr4P49660 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sstr4P49660 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sstr4P49660 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sstr4P49660 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sstr4P49660 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sstr4P49660 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sstr4P49660 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sstr4P49660 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sstr4P49660 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sstr4P49660 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sstr4P49660 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sstr4P49660 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sstr4P49660 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sstr4P49660 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sstr4P49660 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sstr4P49660 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sstr4P49660 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sstr4P49660 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sstr4P49660 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sstr4P49660 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sstr4P49660 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sstr4P49660 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sstr4P49660 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sstr4P49660 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sstr4P49660 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sstr4P49660 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sstr4P49660 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sstr4P49660 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sstr4P49660 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Sstr4P49660 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sstr4P49660 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sstr4P49660 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sstr4P49660 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sstr4P49660 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sstr4P49660 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sstr4P49660 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Sstr4P49660 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sstr4P49660 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sstr4P49660 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sstr4P49660 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sstr4P49660 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sstr4P49660 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sstr4P49660 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sstr4P49660 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sstr4P49660 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sstr4P49660 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sstr4P49660 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sstr4P49660 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sstr4P49660 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sstr4P49660 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sstr4P49660 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sstr4P49660 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sstr4P49660 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sstr4P49660 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sstr4P49660 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sstr4P49660 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sstr4P49660 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sstr4P49660 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sstr4P49660 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sstr4P49660 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sstr4P49660 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms