Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PtpreP49446 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PtpreP49446 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PtpreP49446 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PtpreP49446 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PtpreP49446 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtpreP49446 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtpreP49446 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtpreP49446 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtpreP49446 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PtpreP49446 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PtpreP49446 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PtpreP49446 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PtpreP49446 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PtpreP49446 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PtpreP49446 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PtpreP49446 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PtpreP49446 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PtpreP49446 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PtpreP49446 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PtpreP49446 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PtpreP49446 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtpreP49446 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtpreP49446 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtpreP49446 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtpreP49446 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtpreP49446 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtpreP49446 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtpreP49446 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtpreP49446 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtpreP49446 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtpreP49446 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtpreP49446 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtpreP49446 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtpreP49446 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtpreP49446 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtpreP49446 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PtpreP49446 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PtpreP49446 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtpreP49446 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtpreP49446 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtpreP49446 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtpreP49446 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PtpreP49446 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtpreP49446 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtpreP49446 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtpreP49446 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtpreP49446 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtpreP49446 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtpreP49446 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtpreP49446 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtpreP49446 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtpreP49446 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtpreP49446 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtpreP49446 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtpreP49446 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtpreP49446 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtpreP49446 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtpreP49446 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtpreP49446 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtpreP49446 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PtpreP49446 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtpreP49446 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtpreP49446 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PtpreP49446 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PtpreP49446 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtpreP49446 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtpreP49446 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtpreP49446 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtpreP49446 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtpreP49446 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PtpreP49446 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtpreP49446 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtpreP49446 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtpreP49446 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtpreP49446 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtpreP49446 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtpreP49446 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtpreP49446 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtpreP49446 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtpreP49446 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtpreP49446 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtpreP49446 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtpreP49446 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtpreP49446 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtpreP49446 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtpreP49446 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtpreP49446 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PtpreP49446 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PtpreP49446 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PtpreP49446 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PtpreP49446 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PtpreP49446 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PtpreP49446 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PtpreP49446 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PtpreP49446 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PtpreP49446 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PtpreP49446 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PtpreP49446 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PtpreP49446 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
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