Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CitP49025 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CitP49025 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CitP49025 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CitP49025 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CitP49025 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CitP49025 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CitP49025 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CitP49025 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CitP49025 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CitP49025 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CitP49025 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CitP49025 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CitP49025 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CitP49025 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CitP49025 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CitP49025 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CitP49025 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CitP49025 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CitP49025 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CitP49025 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CitP49025 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CitP49025 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CitP49025 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CitP49025 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CitP49025 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CitP49025 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CitP49025 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CitP49025 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CitP49025 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CitP49025 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CitP49025 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CitP49025 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CitP49025 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CitP49025 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CitP49025 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CitP49025 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CitP49025 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CitP49025 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CitP49025 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CitP49025 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CitP49025 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CitP49025 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CitP49025 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CitP49025 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CitP49025 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CitP49025 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CitP49025 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CitP49025 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CitP49025 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CitP49025 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CitP49025 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CitP49025 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CitP49025 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CitP49025 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CitP49025 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CitP49025 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CitP49025 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CitP49025 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CitP49025 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CitP49025 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CitP49025 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CitP49025 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CitP49025 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CitP49025 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CitP49025 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CitP49025 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CitP49025 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CitP49025 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CitP49025 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CitP49025 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CitP49025 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CitP49025 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CitP49025 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CitP49025 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CitP49025 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CitP49025 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CitP49025 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CitP49025 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CitP49025 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CitP49025 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CitP49025 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CitP49025 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CitP49025 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CitP49025 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CitP49025 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CitP49025 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CitP49025 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CitP49025 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CitP49025 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CitP49025 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CitP49025 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CitP49025 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CitP49025 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CitP49025 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CitP49025 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CitP49025 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CitP49025 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CitP49025 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CitP49025 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms