Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbx2P48031 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbx2P48031 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbx2P48031 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbx2P48031 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbx2P48031 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbx2P48031 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbx2P48031 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbx2P48031 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbx2P48031 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbx2P48031 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbx2P48031 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbx2P48031 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbx2P48031 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbx2P48031 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbx2P48031 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbx2P48031 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbx2P48031 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbx2P48031 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbx2P48031 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbx2P48031 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbx2P48031 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbx2P48031 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbx2P48031 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbx2P48031 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbx2P48031 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbx2P48031 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbx2P48031 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbx2P48031 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbx2P48031 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbx2P48031 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbx2P48031 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbx2P48031 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbx2P48031 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbx2P48031 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbx2P48031 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbx2P48031 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbx2P48031 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbx2P48031 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbx2P48031 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbx2P48031 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gbx2P48031 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbx2P48031 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbx2P48031 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbx2P48031 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbx2P48031 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbx2P48031 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbx2P48031 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbx2P48031 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbx2P48031 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbx2P48031 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbx2P48031 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gbx2P48031 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbx2P48031 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbx2P48031 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbx2P48031 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbx2P48031 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gbx2P48031 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gbx2P48031 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gbx2P48031 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gbx2P48031 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gbx2P48031 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gbx2P48031 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbx2P48031 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbx2P48031 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbx2P48031 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbx2P48031 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbx2P48031 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbx2P48031 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbx2P48031 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbx2P48031 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbx2P48031 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbx2P48031 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbx2P48031 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbx2P48031 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbx2P48031 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbx2P48031 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbx2P48031 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbx2P48031 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbx2P48031 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbx2P48031 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gbx2P48031 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gbx2P48031 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gbx2P48031 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gbx2P48031 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gbx2P48031 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbx2P48031 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbx2P48031 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbx2P48031 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbx2P48031 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbx2P48031 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbx2P48031 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbx2P48031 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbx2P48031 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbx2P48031 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbx2P48031 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbx2P48031 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbx2P48031 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbx2P48031 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gbx2P48031 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms