Protein–RNA interactions for Protein: P47964

Rpl36, 60S ribosomal protein L36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl36P47964 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpl36P47964 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpl36P47964 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpl36P47964 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpl36P47964 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpl36P47964 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpl36P47964 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpl36P47964 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpl36P47964 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpl36P47964 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpl36P47964 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpl36P47964 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpl36P47964 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpl36P47964 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpl36P47964 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpl36P47964 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpl36P47964 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpl36P47964 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpl36P47964 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpl36P47964 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpl36P47964 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpl36P47964 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpl36P47964 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpl36P47964 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpl36P47964 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpl36P47964 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpl36P47964 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpl36P47964 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpl36P47964 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpl36P47964 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpl36P47964 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpl36P47964 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpl36P47964 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpl36P47964 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpl36P47964 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpl36P47964 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpl36P47964 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpl36P47964 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpl36P47964 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpl36P47964 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpl36P47964 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpl36P47964 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpl36P47964 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpl36P47964 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpl36P47964 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpl36P47964 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpl36P47964 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpl36P47964 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpl36P47964 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpl36P47964 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpl36P47964 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpl36P47964 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpl36P47964 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpl36P47964 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpl36P47964 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpl36P47964 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpl36P47964 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpl36P47964 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpl36P47964 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpl36P47964 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpl36P47964 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpl36P47964 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpl36P47964 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpl36P47964 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpl36P47964 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpl36P47964 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpl36P47964 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpl36P47964 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpl36P47964 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpl36P47964 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpl36P47964 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpl36P47964 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Rpl36P47964 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rpl36P47964 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rpl36P47964 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpl36P47964 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpl36P47964 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpl36P47964 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpl36P47964 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpl36P47964 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpl36P47964 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpl36P47964 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpl36P47964 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpl36P47964 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpl36P47964 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpl36P47964 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpl36P47964 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpl36P47964 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpl36P47964 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpl36P47964 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpl36P47964 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpl36P47964 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpl36P47964 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpl36P47964 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpl36P47964 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpl36P47964 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpl36P47964 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpl36P47964 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpl36P47964 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpl36P47964 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms