Protein–RNA interactions for Protein: P47911

Rpl6, 60S ribosomal protein L6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl6P47911 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl6P47911 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpl6P47911 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpl6P47911 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpl6P47911 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpl6P47911 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpl6P47911 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpl6P47911 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpl6P47911 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpl6P47911 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpl6P47911 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpl6P47911 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpl6P47911 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl6P47911 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl6P47911 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl6P47911 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl6P47911 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl6P47911 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl6P47911 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpl6P47911 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpl6P47911 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl6P47911 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl6P47911 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl6P47911 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl6P47911 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl6P47911 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl6P47911 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl6P47911 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl6P47911 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl6P47911 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl6P47911 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl6P47911 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl6P47911 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl6P47911 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl6P47911 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl6P47911 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl6P47911 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl6P47911 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl6P47911 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl6P47911 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl6P47911 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl6P47911 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rpl6P47911 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpl6P47911 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpl6P47911 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpl6P47911 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl6P47911 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl6P47911 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl6P47911 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl6P47911 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl6P47911 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl6P47911 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl6P47911 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl6P47911 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl6P47911 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl6P47911 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl6P47911 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl6P47911 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl6P47911 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl6P47911 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl6P47911 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl6P47911 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpl6P47911 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpl6P47911 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpl6P47911 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpl6P47911 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rpl6P47911 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rpl6P47911 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl6P47911 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl6P47911 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl6P47911 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl6P47911 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl6P47911 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl6P47911 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl6P47911 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl6P47911 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl6P47911 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl6P47911 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl6P47911 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl6P47911 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpl6P47911 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpl6P47911 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpl6P47911 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpl6P47911 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpl6P47911 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpl6P47911 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl6P47911 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl6P47911 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl6P47911 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rpl6P47911 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl6P47911 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl6P47911 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl6P47911 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl6P47911 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl6P47911 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl6P47911 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl6P47911 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl6P47911 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl6P47911 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl6P47911 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms