Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scg3P47867 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scg3P47867 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scg3P47867 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scg3P47867 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scg3P47867 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scg3P47867 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scg3P47867 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scg3P47867 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scg3P47867 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scg3P47867 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scg3P47867 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scg3P47867 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scg3P47867 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scg3P47867 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scg3P47867 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scg3P47867 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scg3P47867 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Scg3P47867 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scg3P47867 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Scg3P47867 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scg3P47867 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scg3P47867 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scg3P47867 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Scg3P47867 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scg3P47867 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scg3P47867 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scg3P47867 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scg3P47867 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scg3P47867 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scg3P47867 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scg3P47867 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scg3P47867 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scg3P47867 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scg3P47867 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scg3P47867 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scg3P47867 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scg3P47867 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scg3P47867 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Scg3P47867 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scg3P47867 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scg3P47867 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scg3P47867 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Scg3P47867 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scg3P47867 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scg3P47867 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Scg3P47867 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scg3P47867 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scg3P47867 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scg3P47867 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scg3P47867 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scg3P47867 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scg3P47867 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scg3P47867 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scg3P47867 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scg3P47867 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scg3P47867 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scg3P47867 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scg3P47867 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scg3P47867 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scg3P47867 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scg3P47867 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scg3P47867 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scg3P47867 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scg3P47867 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scg3P47867 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scg3P47867 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scg3P47867 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scg3P47867 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scg3P47867 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Scg3P47867 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scg3P47867 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scg3P47867 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scg3P47867 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scg3P47867 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scg3P47867 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Scg3P47867 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Scg3P47867 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scg3P47867 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Scg3P47867 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scg3P47867 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scg3P47867 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scg3P47867 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scg3P47867 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scg3P47867 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scg3P47867 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scg3P47867 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scg3P47867 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scg3P47867 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scg3P47867 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scg3P47867 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scg3P47867 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scg3P47867 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scg3P47867 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scg3P47867 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scg3P47867 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scg3P47867 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scg3P47867 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Scg3P47867 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scg3P47867 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98 ms