Protein–RNA interactions for Protein: P47801

Emp1, Epithelial membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emp1P47801 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Emp1P47801 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Emp1P47801 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Emp1P47801 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Emp1P47801 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Emp1P47801 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Emp1P47801 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Emp1P47801 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Emp1P47801 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Emp1P47801 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Emp1P47801 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Emp1P47801 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Emp1P47801 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Emp1P47801 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Emp1P47801 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Emp1P47801 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Emp1P47801 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Emp1P47801 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Emp1P47801 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Emp1P47801 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Emp1P47801 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Emp1P47801 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Emp1P47801 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Emp1P47801 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Emp1P47801 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Emp1P47801 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Emp1P47801 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23■■□□□ 1.27
Emp1P47801 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Emp1P47801 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Emp1P47801 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Emp1P47801 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Emp1P47801 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Emp1P47801 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Emp1P47801 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Emp1P47801 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Emp1P47801 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Emp1P47801 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Emp1P47801 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Emp1P47801 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Emp1P47801 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Emp1P47801 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Emp1P47801 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Emp1P47801 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Emp1P47801 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Emp1P47801 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Emp1P47801 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Emp1P47801 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Emp1P47801 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Emp1P47801 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Emp1P47801 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Emp1P47801 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Emp1P47801 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Emp1P47801 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Emp1P47801 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Emp1P47801 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Emp1P47801 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Emp1P47801 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Emp1P47801 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Emp1P47801 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Emp1P47801 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Emp1P47801 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Emp1P47801 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Emp1P47801 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Emp1P47801 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Emp1P47801 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Emp1P47801 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Emp1P47801 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Emp1P47801 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Emp1P47801 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Emp1P47801 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Emp1P47801 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Emp1P47801 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Emp1P47801 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Emp1P47801 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Emp1P47801 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Emp1P47801 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Emp1P47801 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Emp1P47801 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Emp1P47801 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Emp1P47801 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Emp1P47801 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Emp1P47801 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Emp1P47801 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Emp1P47801 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Emp1P47801 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Emp1P47801 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Emp1P47801 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Emp1P47801 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Emp1P47801 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Emp1P47801 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Emp1P47801 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Emp1P47801 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Emp1P47801 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Emp1P47801 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Emp1P47801 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Emp1P47801 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Emp1P47801 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Emp1P47801 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Emp1P47801 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Emp1P47801 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms