Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SrprbP47758 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SrprbP47758 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SrprbP47758 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SrprbP47758 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SrprbP47758 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SrprbP47758 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SrprbP47758 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SrprbP47758 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SrprbP47758 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SrprbP47758 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SrprbP47758 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SrprbP47758 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SrprbP47758 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SrprbP47758 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SrprbP47758 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SrprbP47758 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SrprbP47758 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SrprbP47758 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SrprbP47758 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SrprbP47758 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SrprbP47758 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SrprbP47758 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SrprbP47758 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SrprbP47758 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SrprbP47758 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SrprbP47758 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SrprbP47758 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SrprbP47758 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SrprbP47758 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SrprbP47758 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SrprbP47758 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SrprbP47758 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SrprbP47758 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SrprbP47758 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SrprbP47758 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SrprbP47758 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SrprbP47758 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SrprbP47758 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SrprbP47758 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SrprbP47758 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SrprbP47758 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SrprbP47758 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SrprbP47758 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SrprbP47758 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SrprbP47758 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SrprbP47758 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SrprbP47758 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SrprbP47758 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SrprbP47758 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SrprbP47758 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SrprbP47758 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SrprbP47758 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SrprbP47758 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SrprbP47758 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SrprbP47758 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SrprbP47758 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SrprbP47758 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SrprbP47758 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SrprbP47758 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SrprbP47758 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SrprbP47758 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SrprbP47758 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SrprbP47758 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SrprbP47758 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SrprbP47758 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SrprbP47758 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SrprbP47758 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SrprbP47758 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
SrprbP47758 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SrprbP47758 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SrprbP47758 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SrprbP47758 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SrprbP47758 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SrprbP47758 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SrprbP47758 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SrprbP47758 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SrprbP47758 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SrprbP47758 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SrprbP47758 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SrprbP47758 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SrprbP47758 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SrprbP47758 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SrprbP47758 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SrprbP47758 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SrprbP47758 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SrprbP47758 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SrprbP47758 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SrprbP47758 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SrprbP47758 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SrprbP47758 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SrprbP47758 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SrprbP47758 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SrprbP47758 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SrprbP47758 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SrprbP47758 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SrprbP47758 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SrprbP47758 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SrprbP47758 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SrprbP47758 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms