Protein–RNA interactions for Protein: P46735

Myo1b, Unconventional myosin-Ib, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1bP46735 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Myo1bP46735 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28,77■■■□□ 2,2
Myo1bP46735 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Myo1bP46735 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Myo1bP46735 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Myo1bP46735 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Myo1bP46735 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Myo1bP46735 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Myo1bP46735 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Myo1bP46735 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Myo1bP46735 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Myo1bP46735 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,72■■■□□ 2,19
Myo1bP46735 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28,72■■■□□ 2,19
Myo1bP46735 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Myo1bP46735 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,71■■■□□ 2,19
Myo1bP46735 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,71■■■□□ 2,19
Myo1bP46735 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
Myo1bP46735 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Myo1bP46735 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28,69■■■□□ 2,18
Myo1bP46735 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Myo1bP46735 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Myo1bP46735 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Myo1bP46735 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,67■■■□□ 2,18
Myo1bP46735 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28,67■■■□□ 2,18
Myo1bP46735 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Myo1bP46735 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Myo1bP46735 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28,65■■■□□ 2,18
Myo1bP46735 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28,64■■■□□ 2,18
Myo1bP46735 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Myo1bP46735 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Myo1bP46735 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Myo1bP46735 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Myo1bP46735 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Myo1bP46735 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28,6■■■□□ 2,17
Myo1bP46735 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Myo1bP46735 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28,59■■■□□ 2,17
Myo1bP46735 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Myo1bP46735 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Myo1bP46735 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Myo1bP46735 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Myo1bP46735 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Myo1bP46735 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Myo1bP46735 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28,57■■■□□ 2,16
Myo1bP46735 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Myo1bP46735 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,56■■■□□ 2,16
Myo1bP46735 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Myo1bP46735 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Myo1bP46735 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Myo1bP46735 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Myo1bP46735 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Myo1bP46735 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Myo1bP46735 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Myo1bP46735 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Myo1bP46735 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28,52■■■□□ 2,16
Myo1bP46735 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,16
Myo1bP46735 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Myo1bP46735 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Myo1bP46735 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Myo1bP46735 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Myo1bP46735 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Myo1bP46735 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Myo1bP46735 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Myo1bP46735 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Myo1bP46735 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Myo1bP46735 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Myo1bP46735 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Myo1bP46735 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Myo1bP46735 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28,45■■■□□ 2,14
Myo1bP46735 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28,45■■■□□ 2,14
Myo1bP46735 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28,45■■■□□ 2,14
Myo1bP46735 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Myo1bP46735 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Myo1bP46735 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Myo1bP46735 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Myo1bP46735 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Myo1bP46735 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Myo1bP46735 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Myo1bP46735 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Myo1bP46735 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Myo1bP46735 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,39■■■□□ 2,14
Myo1bP46735 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28,39■■■□□ 2,14
Myo1bP46735 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Myo1bP46735 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28,38■■■□□ 2,13
Myo1bP46735 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Myo1bP46735 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Myo1bP46735 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Myo1bP46735 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Myo1bP46735 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Myo1bP46735 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Myo1bP46735 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Myo1bP46735 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Myo1bP46735 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Myo1bP46735 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Myo1bP46735 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Myo1bP46735 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Myo1bP46735 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Myo1bP46735 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Myo1bP46735 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Myo1bP46735 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Myo1bP46735 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,3 ms