Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zic1P46684 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zic1P46684 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zic1P46684 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zic1P46684 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zic1P46684 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zic1P46684 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zic1P46684 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zic1P46684 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zic1P46684 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zic1P46684 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zic1P46684 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zic1P46684 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zic1P46684 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Zic1P46684 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zic1P46684 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zic1P46684 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zic1P46684 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Zic1P46684 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zic1P46684 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Zic1P46684 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zic1P46684 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zic1P46684 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zic1P46684 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Zic1P46684 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zic1P46684 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zic1P46684 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zic1P46684 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Zic1P46684 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zic1P46684 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zic1P46684 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zic1P46684 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zic1P46684 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zic1P46684 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zic1P46684 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zic1P46684 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zic1P46684 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zic1P46684 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zic1P46684 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zic1P46684 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zic1P46684 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Zic1P46684 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zic1P46684 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zic1P46684 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zic1P46684 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zic1P46684 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zic1P46684 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zic1P46684 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zic1P46684 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zic1P46684 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zic1P46684 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zic1P46684 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zic1P46684 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zic1P46684 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zic1P46684 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zic1P46684 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zic1P46684 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zic1P46684 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zic1P46684 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zic1P46684 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zic1P46684 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zic1P46684 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zic1P46684 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zic1P46684 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zic1P46684 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zic1P46684 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zic1P46684 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zic1P46684 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zic1P46684 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zic1P46684 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zic1P46684 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zic1P46684 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zic1P46684 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zic1P46684 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zic1P46684 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zic1P46684 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zic1P46684 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zic1P46684 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zic1P46684 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zic1P46684 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zic1P46684 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zic1P46684 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zic1P46684 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zic1P46684 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zic1P46684 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zic1P46684 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zic1P46684 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zic1P46684 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zic1P46684 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zic1P46684 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zic1P46684 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zic1P46684 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zic1P46684 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Zic1P46684 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Zic1P46684 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zic1P46684 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zic1P46684 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zic1P46684 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zic1P46684 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zic1P46684 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms