Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfsf4P43488 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfsf4P43488 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfsf4P43488 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfsf4P43488 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfsf4P43488 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfsf4P43488 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfsf4P43488 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfsf4P43488 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfsf4P43488 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfsf4P43488 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfsf4P43488 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfsf4P43488 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfsf4P43488 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfsf4P43488 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfsf4P43488 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfsf4P43488 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfsf4P43488 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfsf4P43488 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfsf4P43488 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfsf4P43488 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfsf4P43488 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfsf4P43488 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfsf4P43488 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfsf4P43488 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfsf4P43488 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnfsf4P43488 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnfsf4P43488 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnfsf4P43488 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnfsf4P43488 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnfsf4P43488 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfsf4P43488 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfsf4P43488 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfsf4P43488 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfsf4P43488 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfsf4P43488 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfsf4P43488 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfsf4P43488 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfsf4P43488 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfsf4P43488 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfsf4P43488 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfsf4P43488 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfsf4P43488 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfsf4P43488 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfsf4P43488 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfsf4P43488 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfsf4P43488 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnfsf4P43488 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnfsf4P43488 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnfsf4P43488 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfsf4P43488 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfsf4P43488 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfsf4P43488 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfsf4P43488 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfsf4P43488 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfsf4P43488 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfsf4P43488 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfsf4P43488 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfsf4P43488 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfsf4P43488 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfsf4P43488 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfsf4P43488 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfsf4P43488 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfsf4P43488 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfsf4P43488 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfsf4P43488 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfsf4P43488 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfsf4P43488 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfsf4P43488 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfsf4P43488 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfsf4P43488 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfsf4P43488 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfsf4P43488 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfsf4P43488 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfsf4P43488 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfsf4P43488 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfsf4P43488 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfsf4P43488 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfsf4P43488 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfsf4P43488 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfsf4P43488 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfsf4P43488 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfsf4P43488 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfsf4P43488 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfsf4P43488 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfsf4P43488 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfsf4P43488 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfsf4P43488 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfsf4P43488 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfsf4P43488 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfsf4P43488 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfsf4P43488 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfsf4P43488 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfsf4P43488 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfsf4P43488 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfsf4P43488 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfsf4P43488 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfsf4P43488 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfsf4P43488 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfsf4P43488 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms