Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtgfrP43117 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtgfrP43117 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtgfrP43117 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtgfrP43117 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtgfrP43117 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtgfrP43117 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtgfrP43117 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PtgfrP43117 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtgfrP43117 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtgfrP43117 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtgfrP43117 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtgfrP43117 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PtgfrP43117 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtgfrP43117 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtgfrP43117 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtgfrP43117 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtgfrP43117 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtgfrP43117 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtgfrP43117 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtgfrP43117 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtgfrP43117 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtgfrP43117 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtgfrP43117 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtgfrP43117 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PtgfrP43117 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PtgfrP43117 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtgfrP43117 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtgfrP43117 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtgfrP43117 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtgfrP43117 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtgfrP43117 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtgfrP43117 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtgfrP43117 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtgfrP43117 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtgfrP43117 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtgfrP43117 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtgfrP43117 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtgfrP43117 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtgfrP43117 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtgfrP43117 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PtgfrP43117 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtgfrP43117 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtgfrP43117 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtgfrP43117 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtgfrP43117 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtgfrP43117 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtgfrP43117 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtgfrP43117 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtgfrP43117 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtgfrP43117 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtgfrP43117 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtgfrP43117 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtgfrP43117 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtgfrP43117 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtgfrP43117 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtgfrP43117 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtgfrP43117 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtgfrP43117 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtgfrP43117 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtgfrP43117 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtgfrP43117 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtgfrP43117 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtgfrP43117 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtgfrP43117 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtgfrP43117 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtgfrP43117 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtgfrP43117 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtgfrP43117 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtgfrP43117 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtgfrP43117 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtgfrP43117 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtgfrP43117 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtgfrP43117 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtgfrP43117 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtgfrP43117 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtgfrP43117 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtgfrP43117 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtgfrP43117 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtgfrP43117 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtgfrP43117 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtgfrP43117 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtgfrP43117 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtgfrP43117 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtgfrP43117 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtgfrP43117 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtgfrP43117 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtgfrP43117 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PtgfrP43117 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtgfrP43117 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtgfrP43117 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtgfrP43117 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtgfrP43117 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtgfrP43117 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtgfrP43117 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtgfrP43117 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtgfrP43117 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtgfrP43117 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PtgfrP43117 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtgfrP43117 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms