Protein–RNA interactions for Protein: P42932

Cct8, T-complex protein 1 subunit theta, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct8P42932 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cct8P42932 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cct8P42932 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cct8P42932 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cct8P42932 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cct8P42932 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cct8P42932 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cct8P42932 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cct8P42932 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cct8P42932 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cct8P42932 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cct8P42932 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cct8P42932 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cct8P42932 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cct8P42932 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cct8P42932 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cct8P42932 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cct8P42932 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cct8P42932 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cct8P42932 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cct8P42932 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cct8P42932 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cct8P42932 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cct8P42932 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cct8P42932 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cct8P42932 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cct8P42932 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cct8P42932 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cct8P42932 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cct8P42932 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cct8P42932 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cct8P42932 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cct8P42932 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cct8P42932 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cct8P42932 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cct8P42932 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cct8P42932 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cct8P42932 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cct8P42932 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cct8P42932 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cct8P42932 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cct8P42932 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cct8P42932 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cct8P42932 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cct8P42932 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cct8P42932 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cct8P42932 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cct8P42932 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cct8P42932 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cct8P42932 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cct8P42932 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cct8P42932 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cct8P42932 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cct8P42932 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cct8P42932 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cct8P42932 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cct8P42932 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cct8P42932 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cct8P42932 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cct8P42932 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cct8P42932 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cct8P42932 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cct8P42932 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cct8P42932 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cct8P42932 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cct8P42932 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cct8P42932 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cct8P42932 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cct8P42932 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cct8P42932 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cct8P42932 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cct8P42932 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cct8P42932 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cct8P42932 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cct8P42932 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cct8P42932 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cct8P42932 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cct8P42932 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cct8P42932 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cct8P42932 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cct8P42932 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cct8P42932 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cct8P42932 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cct8P42932 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cct8P42932 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cct8P42932 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cct8P42932 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cct8P42932 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cct8P42932 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cct8P42932 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cct8P42932 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cct8P42932 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cct8P42932 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cct8P42932 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cct8P42932 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cct8P42932 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cct8P42932 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cct8P42932 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cct8P42932 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cct8P42932 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms