Protein–RNA interactions for Protein: P42932

Cct8, T-complex protein 1 subunit theta, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct8P42932 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cct8P42932 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cct8P42932 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cct8P42932 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cct8P42932 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cct8P42932 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cct8P42932 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cct8P42932 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cct8P42932 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cct8P42932 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cct8P42932 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cct8P42932 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cct8P42932 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cct8P42932 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cct8P42932 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cct8P42932 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cct8P42932 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cct8P42932 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cct8P42932 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cct8P42932 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cct8P42932 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cct8P42932 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cct8P42932 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cct8P42932 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cct8P42932 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cct8P42932 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cct8P42932 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cct8P42932 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cct8P42932 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cct8P42932 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cct8P42932 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cct8P42932 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cct8P42932 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cct8P42932 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cct8P42932 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cct8P42932 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cct8P42932 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cct8P42932 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cct8P42932 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cct8P42932 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cct8P42932 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cct8P42932 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cct8P42932 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cct8P42932 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cct8P42932 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cct8P42932 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cct8P42932 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cct8P42932 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cct8P42932 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cct8P42932 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cct8P42932 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cct8P42932 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cct8P42932 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cct8P42932 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cct8P42932 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cct8P42932 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cct8P42932 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cct8P42932 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cct8P42932 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cct8P42932 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cct8P42932 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cct8P42932 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cct8P42932 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cct8P42932 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cct8P42932 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cct8P42932 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cct8P42932 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cct8P42932 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cct8P42932 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cct8P42932 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cct8P42932 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cct8P42932 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cct8P42932 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cct8P42932 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cct8P42932 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cct8P42932 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cct8P42932 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cct8P42932 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cct8P42932 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cct8P42932 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cct8P42932 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cct8P42932 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cct8P42932 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cct8P42932 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cct8P42932 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cct8P42932 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cct8P42932 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cct8P42932 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cct8P42932 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cct8P42932 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cct8P42932 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cct8P42932 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cct8P42932 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cct8P42932 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cct8P42932 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cct8P42932 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cct8P42932 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cct8P42932 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cct8P42932 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cct8P42932 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms