Protein–RNA interactions for Protein: P42586

Nkx2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-2P42586 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx2-2P42586 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx2-2P42586 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx2-2P42586 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx2-2P42586 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx2-2P42586 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx2-2P42586 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx2-2P42586 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx2-2P42586 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx2-2P42586 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nkx2-2P42586 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nkx2-2P42586 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nkx2-2P42586 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nkx2-2P42586 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx2-2P42586 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkx2-2P42586 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx2-2P42586 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx2-2P42586 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx2-2P42586 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx2-2P42586 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx2-2P42586 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx2-2P42586 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx2-2P42586 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx2-2P42586 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx2-2P42586 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx2-2P42586 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx2-2P42586 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx2-2P42586 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx2-2P42586 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx2-2P42586 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx2-2P42586 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx2-2P42586 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx2-2P42586 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx2-2P42586 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx2-2P42586 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx2-2P42586 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx2-2P42586 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx2-2P42586 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx2-2P42586 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx2-2P42586 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx2-2P42586 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx2-2P42586 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx2-2P42586 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx2-2P42586 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx2-2P42586 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx2-2P42586 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx2-2P42586 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx2-2P42586 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx2-2P42586 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx2-2P42586 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx2-2P42586 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx2-2P42586 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkx2-2P42586 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkx2-2P42586 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkx2-2P42586 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx2-2P42586 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx2-2P42586 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx2-2P42586 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx2-2P42586 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx2-2P42586 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx2-2P42586 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx2-2P42586 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx2-2P42586 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkx2-2P42586 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nkx2-2P42586 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nkx2-2P42586 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nkx2-2P42586 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nkx2-2P42586 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nkx2-2P42586 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nkx2-2P42586 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nkx2-2P42586 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nkx2-2P42586 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nkx2-2P42586 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkx2-2P42586 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkx2-2P42586 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkx2-2P42586 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nkx2-2P42586 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nkx2-2P42586 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nkx2-2P42586 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nkx2-2P42586 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkx2-2P42586 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx2-2P42586 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx2-2P42586 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx2-2P42586 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx2-2P42586 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx2-2P42586 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkx2-2P42586 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkx2-2P42586 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkx2-2P42586 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkx2-2P42586 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkx2-2P42586 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkx2-2P42586 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkx2-2P42586 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nkx2-2P42586 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nkx2-2P42586 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx2-2P42586 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx2-2P42586 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nkx2-2P42586 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx2-2P42586 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx2-2P42586 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms