Protein–RNA interactions for Protein: P39038

Cdh4, Cadherin-4, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh4P39038 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdh4P39038 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh4P39038 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh4P39038 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh4P39038 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh4P39038 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh4P39038 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh4P39038 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh4P39038 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh4P39038 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh4P39038 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh4P39038 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh4P39038 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh4P39038 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh4P39038 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh4P39038 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh4P39038 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh4P39038 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh4P39038 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh4P39038 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh4P39038 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh4P39038 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh4P39038 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh4P39038 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh4P39038 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh4P39038 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh4P39038 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh4P39038 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh4P39038 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh4P39038 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh4P39038 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh4P39038 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh4P39038 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh4P39038 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh4P39038 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh4P39038 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh4P39038 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh4P39038 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh4P39038 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh4P39038 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh4P39038 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh4P39038 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh4P39038 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh4P39038 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh4P39038 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh4P39038 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh4P39038 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh4P39038 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh4P39038 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh4P39038 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh4P39038 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh4P39038 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh4P39038 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh4P39038 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh4P39038 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh4P39038 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh4P39038 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh4P39038 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh4P39038 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh4P39038 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh4P39038 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh4P39038 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh4P39038 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh4P39038 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh4P39038 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh4P39038 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh4P39038 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh4P39038 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh4P39038 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh4P39038 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh4P39038 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh4P39038 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh4P39038 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdh4P39038 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdh4P39038 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdh4P39038 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdh4P39038 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdh4P39038 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdh4P39038 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh4P39038 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh4P39038 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh4P39038 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh4P39038 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh4P39038 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh4P39038 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdh4P39038 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdh4P39038 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh4P39038 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh4P39038 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh4P39038 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdh4P39038 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdh4P39038 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh4P39038 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh4P39038 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh4P39038 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdh4P39038 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdh4P39038 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdh4P39038 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdh4P39038 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdh4P39038 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms