Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ptpn1P35821 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ptpn1P35821 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ptpn1P35821 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ptpn1P35821 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ptpn1P35821 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ptpn1P35821 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ptpn1P35821 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ptpn1P35821 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ptpn1P35821 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ptpn1P35821 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ptpn1P35821 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ptpn1P35821 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ptpn1P35821 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptpn1P35821 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptpn1P35821 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptpn1P35821 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptpn1P35821 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptpn1P35821 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ptpn1P35821 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ptpn1P35821 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptpn1P35821 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptpn1P35821 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptpn1P35821 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptpn1P35821 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptpn1P35821 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptpn1P35821 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptpn1P35821 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptpn1P35821 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptpn1P35821 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptpn1P35821 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ptpn1P35821 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ptpn1P35821 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ptpn1P35821 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ptpn1P35821 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ptpn1P35821 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ptpn1P35821 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ptpn1P35821 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ptpn1P35821 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ptpn1P35821 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ptpn1P35821 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ptpn1P35821 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptpn1P35821 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptpn1P35821 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptpn1P35821 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptpn1P35821 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptpn1P35821 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptpn1P35821 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ptpn1P35821 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ptpn1P35821 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptpn1P35821 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptpn1P35821 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptpn1P35821 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptpn1P35821 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptpn1P35821 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptpn1P35821 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptpn1P35821 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ptpn1P35821 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ptpn1P35821 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpn1P35821 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpn1P35821 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpn1P35821 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpn1P35821 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptpn1P35821 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptpn1P35821 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptpn1P35821 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptpn1P35821 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptpn1P35821 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptpn1P35821 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptpn1P35821 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptpn1P35821 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptpn1P35821 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptpn1P35821 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptpn1P35821 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptpn1P35821 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptpn1P35821 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptpn1P35821 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptpn1P35821 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptpn1P35821 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptpn1P35821 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptpn1P35821 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptpn1P35821 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ptpn1P35821 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptpn1P35821 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptpn1P35821 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptpn1P35821 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptpn1P35821 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptpn1P35821 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptpn1P35821 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptpn1P35821 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptpn1P35821 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptpn1P35821 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptpn1P35821 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ptpn1P35821 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptpn1P35821 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptpn1P35821 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptpn1P35821 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptpn1P35821 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptpn1P35821 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptpn1P35821 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms