Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ercc5P35689 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ercc5P35689 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ercc5P35689 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ercc5P35689 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ercc5P35689 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ercc5P35689 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ercc5P35689 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ercc5P35689 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ercc5P35689 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ercc5P35689 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ercc5P35689 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ercc5P35689 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ercc5P35689 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ercc5P35689 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ercc5P35689 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ercc5P35689 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ercc5P35689 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ercc5P35689 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ercc5P35689 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ercc5P35689 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ercc5P35689 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ercc5P35689 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ercc5P35689 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ercc5P35689 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ercc5P35689 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ercc5P35689 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ercc5P35689 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ercc5P35689 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ercc5P35689 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ercc5P35689 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ercc5P35689 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ercc5P35689 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ercc5P35689 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ercc5P35689 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ercc5P35689 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ercc5P35689 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ercc5P35689 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ercc5P35689 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ercc5P35689 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ercc5P35689 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ercc5P35689 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ercc5P35689 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ercc5P35689 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ercc5P35689 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ercc5P35689 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ercc5P35689 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ercc5P35689 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ercc5P35689 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ercc5P35689 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ercc5P35689 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ercc5P35689 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ercc5P35689 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ercc5P35689 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ercc5P35689 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ercc5P35689 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ercc5P35689 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms