Protein–RNA interactions for Protein: P35343

Cxcr2, C-X-C chemokine receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr2P35343 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cxcr2P35343 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cxcr2P35343 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cxcr2P35343 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cxcr2P35343 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cxcr2P35343 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cxcr2P35343 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cxcr2P35343 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cxcr2P35343 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cxcr2P35343 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cxcr2P35343 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cxcr2P35343 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cxcr2P35343 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cxcr2P35343 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cxcr2P35343 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cxcr2P35343 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cxcr2P35343 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cxcr2P35343 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cxcr2P35343 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cxcr2P35343 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cxcr2P35343 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cxcr2P35343 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cxcr2P35343 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cxcr2P35343 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cxcr2P35343 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cxcr2P35343 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cxcr2P35343 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cxcr2P35343 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cxcr2P35343 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cxcr2P35343 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cxcr2P35343 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cxcr2P35343 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cxcr2P35343 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cxcr2P35343 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cxcr2P35343 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cxcr2P35343 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cxcr2P35343 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cxcr2P35343 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cxcr2P35343 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cxcr2P35343 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cxcr2P35343 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cxcr2P35343 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cxcr2P35343 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cxcr2P35343 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cxcr2P35343 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cxcr2P35343 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cxcr2P35343 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cxcr2P35343 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cxcr2P35343 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cxcr2P35343 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cxcr2P35343 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cxcr2P35343 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cxcr2P35343 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cxcr2P35343 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cxcr2P35343 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cxcr2P35343 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cxcr2P35343 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cxcr2P35343 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cxcr2P35343 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cxcr2P35343 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cxcr2P35343 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cxcr2P35343 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cxcr2P35343 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cxcr2P35343 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cxcr2P35343 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cxcr2P35343 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cxcr2P35343 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cxcr2P35343 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cxcr2P35343 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cxcr2P35343 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cxcr2P35343 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cxcr2P35343 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cxcr2P35343 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cxcr2P35343 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cxcr2P35343 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cxcr2P35343 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cxcr2P35343 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cxcr2P35343 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cxcr2P35343 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cxcr2P35343 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cxcr2P35343 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cxcr2P35343 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cxcr2P35343 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cxcr2P35343 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cxcr2P35343 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cxcr2P35343 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cxcr2P35343 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cxcr2P35343 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cxcr2P35343 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cxcr2P35343 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cxcr2P35343 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cxcr2P35343 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cxcr2P35343 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cxcr2P35343 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cxcr2P35343 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cxcr2P35343 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cxcr2P35343 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cxcr2P35343 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cxcr2P35343 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cxcr2P35343 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms