Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp4P35123 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp4P35123 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp4P35123 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp4P35123 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp4P35123 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp4P35123 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp4P35123 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp4P35123 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp4P35123 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp4P35123 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp4P35123 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp4P35123 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp4P35123 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp4P35123 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp4P35123 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp4P35123 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp4P35123 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp4P35123 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp4P35123 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp4P35123 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp4P35123 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp4P35123 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp4P35123 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp4P35123 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp4P35123 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp4P35123 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp4P35123 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp4P35123 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp4P35123 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp4P35123 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp4P35123 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp4P35123 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp4P35123 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp4P35123 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp4P35123 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp4P35123 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp4P35123 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp4P35123 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp4P35123 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp4P35123 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp4P35123 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp4P35123 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp4P35123 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp4P35123 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp4P35123 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp4P35123 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp4P35123 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp4P35123 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp4P35123 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp4P35123 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp4P35123 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp4P35123 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp4P35123 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp4P35123 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp4P35123 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp4P35123 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp4P35123 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp4P35123 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp4P35123 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp4P35123 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp4P35123 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp4P35123 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp4P35123 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp4P35123 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp4P35123 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp4P35123 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp4P35123 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp4P35123 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp4P35123 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp4P35123 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp4P35123 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp4P35123 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp4P35123 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp4P35123 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp4P35123 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp4P35123 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp4P35123 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp4P35123 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp4P35123 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp4P35123 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp4P35123 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp4P35123 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp4P35123 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp4P35123 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp4P35123 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp4P35123 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp4P35123 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp4P35123 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp4P35123 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp4P35123 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp4P35123 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp4P35123 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp4P35123 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp4P35123 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp4P35123 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp4P35123 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp4P35123 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp4P35123 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp4P35123 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.6 ms