Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Saa4P31532 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Saa4P31532 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Saa4P31532 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Saa4P31532 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Saa4P31532 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Saa4P31532 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Saa4P31532 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Saa4P31532 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Saa4P31532 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Saa4P31532 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Saa4P31532 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Saa4P31532 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Saa4P31532 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Saa4P31532 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Saa4P31532 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Saa4P31532 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Saa4P31532 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Saa4P31532 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Saa4P31532 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Saa4P31532 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Saa4P31532 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Saa4P31532 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Saa4P31532 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Saa4P31532 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Saa4P31532 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Saa4P31532 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Saa4P31532 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Saa4P31532 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Saa4P31532 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Saa4P31532 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Saa4P31532 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Saa4P31532 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Saa4P31532 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Saa4P31532 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Saa4P31532 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Saa4P31532 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Saa4P31532 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Saa4P31532 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Saa4P31532 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Saa4P31532 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Saa4P31532 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Saa4P31532 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Saa4P31532 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Saa4P31532 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Saa4P31532 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Saa4P31532 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Saa4P31532 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Saa4P31532 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Saa4P31532 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Saa4P31532 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Saa4P31532 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Saa4P31532 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Saa4P31532 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Saa4P31532 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Saa4P31532 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Saa4P31532 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Saa4P31532 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Saa4P31532 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Saa4P31532 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Saa4P31532 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Saa4P31532 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Saa4P31532 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Saa4P31532 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Saa4P31532 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Saa4P31532 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Saa4P31532 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Saa4P31532 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Saa4P31532 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Saa4P31532 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Saa4P31532 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Saa4P31532 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Saa4P31532 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Saa4P31532 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Saa4P31532 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Saa4P31532 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Saa4P31532 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Saa4P31532 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Saa4P31532 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Saa4P31532 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Saa4P31532 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Saa4P31532 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Saa4P31532 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Saa4P31532 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Saa4P31532 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Saa4P31532 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Saa4P31532 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Saa4P31532 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Saa4P31532 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Saa4P31532 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Saa4P31532 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Saa4P31532 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Saa4P31532 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Saa4P31532 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Saa4P31532 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Saa4P31532 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Saa4P31532 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Saa4P31532 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Saa4P31532 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Saa4P31532 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms