Protein–RNA interactions for Protein: P29595

Nedd8, NEDD8, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd8P29595 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nedd8P29595 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nedd8P29595 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nedd8P29595 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nedd8P29595 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nedd8P29595 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nedd8P29595 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nedd8P29595 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nedd8P29595 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nedd8P29595 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nedd8P29595 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nedd8P29595 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nedd8P29595 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nedd8P29595 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nedd8P29595 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nedd8P29595 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nedd8P29595 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nedd8P29595 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nedd8P29595 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nedd8P29595 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nedd8P29595 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nedd8P29595 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nedd8P29595 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nedd8P29595 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nedd8P29595 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nedd8P29595 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nedd8P29595 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nedd8P29595 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nedd8P29595 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nedd8P29595 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nedd8P29595 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nedd8P29595 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nedd8P29595 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nedd8P29595 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nedd8P29595 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nedd8P29595 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nedd8P29595 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nedd8P29595 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nedd8P29595 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nedd8P29595 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nedd8P29595 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nedd8P29595 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nedd8P29595 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nedd8P29595 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nedd8P29595 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nedd8P29595 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nedd8P29595 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nedd8P29595 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nedd8P29595 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nedd8P29595 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nedd8P29595 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nedd8P29595 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nedd8P29595 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nedd8P29595 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nedd8P29595 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nedd8P29595 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nedd8P29595 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nedd8P29595 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nedd8P29595 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nedd8P29595 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nedd8P29595 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nedd8P29595 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nedd8P29595 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nedd8P29595 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nedd8P29595 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nedd8P29595 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nedd8P29595 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nedd8P29595 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nedd8P29595 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nedd8P29595 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nedd8P29595 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nedd8P29595 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nedd8P29595 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nedd8P29595 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nedd8P29595 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nedd8P29595 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nedd8P29595 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nedd8P29595 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nedd8P29595 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nedd8P29595 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nedd8P29595 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nedd8P29595 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nedd8P29595 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nedd8P29595 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nedd8P29595 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Nedd8P29595 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nedd8P29595 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nedd8P29595 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nedd8P29595 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nedd8P29595 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nedd8P29595 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nedd8P29595 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nedd8P29595 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nedd8P29595 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nedd8P29595 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nedd8P29595 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nedd8P29595 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nedd8P29595 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nedd8P29595 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nedd8P29595 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms