Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casp2P29594 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Casp2P29594 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casp2P29594 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casp2P29594 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casp2P29594 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casp2P29594 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casp2P29594 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casp2P29594 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casp2P29594 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casp2P29594 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casp2P29594 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casp2P29594 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casp2P29594 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casp2P29594 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Casp2P29594 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casp2P29594 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casp2P29594 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Casp2P29594 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casp2P29594 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Casp2P29594 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Casp2P29594 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Casp2P29594 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Casp2P29594 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casp2P29594 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casp2P29594 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casp2P29594 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Casp2P29594 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casp2P29594 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Casp2P29594 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Casp2P29594 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Casp2P29594 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Casp2P29594 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Casp2P29594 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casp2P29594 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casp2P29594 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casp2P29594 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casp2P29594 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casp2P29594 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casp2P29594 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casp2P29594 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casp2P29594 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Casp2P29594 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Casp2P29594 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casp2P29594 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casp2P29594 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Casp2P29594 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Casp2P29594 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Casp2P29594 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Casp2P29594 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Casp2P29594 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Casp2P29594 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Casp2P29594 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Casp2P29594 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Casp2P29594 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Casp2P29594 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Casp2P29594 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Casp2P29594 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casp2P29594 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casp2P29594 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casp2P29594 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Casp2P29594 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casp2P29594 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casp2P29594 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casp2P29594 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casp2P29594 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casp2P29594 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casp2P29594 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casp2P29594 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Casp2P29594 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Casp2P29594 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casp2P29594 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casp2P29594 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Casp2P29594 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casp2P29594 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casp2P29594 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casp2P29594 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casp2P29594 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casp2P29594 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casp2P29594 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casp2P29594 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Casp2P29594 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casp2P29594 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casp2P29594 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casp2P29594 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casp2P29594 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casp2P29594 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casp2P29594 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casp2P29594 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casp2P29594 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casp2P29594 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casp2P29594 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casp2P29594 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Casp2P29594 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casp2P29594 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casp2P29594 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casp2P29594 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casp2P29594 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casp2P29594 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casp2P29594 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms